Пакет: cd-hit (4.8.1-4)

Ссылки для cd-hit

Ресурсы Debian:

Исходный код cd-hit:

Сопровождающие:

Внешние ресурсы:

Сайт [weizhongli-lab.org]

Подобные пакеты:

suite of programs designed to quickly group sequences

cd-hit contains a number of programs designed to quickly group sequences. cd-hit groups proteins into clusters that meet a user-defined similarity threshold. cd-hit-est is similar to cd-hit, but designed to group nucleotide sequences (without introns). cd-hit-est-2d is similar to cd-hit-2d but designed to compare two nucleotide datasets. A number of other related programs are also in this package. Please see the cd-hit user manual, also part of this package, for further information.

Теги: Область: Биология, Биоинформатика, Реализовано на: implemented-in::c++, implemented-in::perl, Пользовательский интерфейс: Командная строка, Роль: role::program, use::comparing, Работает с: Биологические последовательности

Другие пакеты, относящиеся к cd-hit

зависимости

рекомендации

предложения

enhances

dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

dep: libc6 (>= 2.7) [не amd64, arm64, ppc64el]
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [не armel, armhf, i386, mipsel]

вспомогательная библиотека GCC

dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386, mipsel]
dep: libgomp1 (>= 6)

вспомогательная библиотека GCC OpenMP (GOMP)
dep: libstdc++6 (>= 5.2)

стандартная библиотека GNU C++ версии 3
dep: perl

практический язык Ларри Уолла для извлечения данных и составления отчётов
dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

библиотека сжатия

Загрузка cd-hit

Загрузить для всех доступных архитектур
Архитектура	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
amd64	510,3 Кб	1 411,0 Кб	[список файлов]
arm64	493,8 Кб	1 309,0 Кб	[список файлов]
armel	491,0 Кб	1 319,0 Кб	[список файлов]
armhf	487,6 Кб	1 111,0 Кб	[список файлов]
i386	511,4 Кб	1 477,0 Кб	[список файлов]
mips64el	510,9 Кб	1 588,0 Кб	[список файлов]
mipsel	511,2 Кб	1 541,0 Кб	[список файлов]
ppc64el	508,7 Кб	1 813,0 Кб	[список файлов]
s390x	496,6 Кб	1 429,0 Кб	[список файлов]