Pakiet: cd-hit (4.8.1-4 i inne)

Odnośniki dla cd-hit

Zasoby systemu Debian:

Pobieranie pakietu źródłowego cd-hit:

Opiekunowie:

Zasoby zewnętrzne:

Strona internetowa [weizhongli-lab.org]

Podobne pakiety:

Pakiet programów przeznaczonych do szybkiego grupowania sekwencji

Pakiet cd-hit zawiera szereg programów przeznaczonych do szybkiego grupowania sekwencji. cd-hit grupuje białka w klastry, które spełniają zdefiniowany przez użytkownika próg podobieństwa. cd-hit-est jest podobny do cd-hit, ale przeznaczony do grupowania sekwencji nukleotydowych (bez intronów). cd-hit-est-2d jest podobny do cd-hit-2d, ale przeznaczony do porównywania dwóch zestawów danych nukleotydów. W tym pakiecie znajduje się również wiele innych powiązanych programów. Więcej informacji można znaleźć w podręczniku użytkownika cd-hit, który również jest częścią tego pakietu.

Znaczniki: Dziedzina: Biologia, Bioinformatyka, Zaimplementowane w: implemented-in::c++, implemented-in::perl, Interfejs użytkownika: Wiersz poleceń, Rola: role::program, use::comparing, Działa z: Sekwencje biologiczne

Inne pakiety związane z cd-hit

wymaga

poleca

sugeruje

enhances

dep: libc6 (>= 2.11) [hppa]

Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

dep: libc6 (>= 2.16) [x32]

dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

dep: libc6 (>= 2.31) [sh4]

dep: libc6 (>= 2.34) [riscv64]

dep: libc6 (>= 2.7) [armel, armhf, i386, m68k, mips64el, ppc64, s390x, sparc64]
dep: libc6.1 (>= 2.31) [ia64]

Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6.1-udeb

dep: libc6.1 (>= 2.7) [alpha]
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, x32]

Biblioteka wspomagająca GCC

dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64, sh4, sparc64]

dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386, ia64]
dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

Biblioteka wspomagająca GCC
dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

Biblioteka wspomagająca GCC
dep: libgomp1 (>= 6)

Biblioteka wspierająca GCC OpenMP (GOMP)
dep: libstdc++6 (>= 13.1) [riscv64]

Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3

dep: libstdc++6 (>= 5.2) [nie riscv64]
dep: libunwind8 [ia64]

Biblioteka do ustalania łańcucha wywołań programu - środowisko uruchomieniowe
dep: perl

praktyczny język ekstrakcji i raportowania Larry'ego Walla
dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

Biblioteka kompresyjna - pliki wykonawcze

Pobieranie cd-hit

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur
Architektura	Wersja	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
alpha (port nieoficjalny)	4.8.1-4	505,8 KiB	1 531,0 KiB	[lista plików]
amd64	4.8.1-4	510,3 KiB	1 411,0 KiB	[lista plików]
arm64	4.8.1-4	493,8 KiB	1 309,0 KiB	[lista plików]
armel	4.8.1-4	491,0 KiB	1 319,0 KiB	[lista plików]
armhf	4.8.1-4	487,6 KiB	1 111,0 KiB	[lista plików]
hppa (port nieoficjalny)	4.8.1-4	506,3 KiB	1 398,0 KiB	[lista plików]
i386	4.8.1-4	511,4 KiB	1 477,0 KiB	[lista plików]
ia64 (port nieoficjalny)	4.8.1-4	525,4 KiB	2 178,0 KiB	[lista plików]
m68k (port nieoficjalny)	4.8.1-4	506,1 KiB	1 423,0 KiB	[lista plików]
mips64el	4.8.1-4	510,9 KiB	1 588,0 KiB	[lista plików]
ppc64 (port nieoficjalny)	4.8.1-4	509,0 KiB	1 813,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	4.8.1-4	508,7 KiB	1 813,0 KiB	[lista plików]
riscv64	4.8.1-4+b1	505,5 KiB	1 236,0 KiB	[lista plików]
s390x	4.8.1-4	496,6 KiB	1 429,0 KiB	[lista plików]
sh4 (port nieoficjalny)	4.8.1-4	510,8 KiB	1 373,0 KiB	[lista plików]
sparc64 (port nieoficjalny)	4.8.1-4	489,5 KiB	1 399,0 KiB	[lista plików]
x32 (port nieoficjalny)	4.8.1-4	506,8 KiB	1 381,0 KiB	[lista plików]