パッケージ: cd-hit (4.8.1-4 など)

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メンテナ:

外部の資源:

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類似のパッケージ:

suite of programs designed to quickly group sequences

cd-hit contains a number of programs designed to quickly group sequences. cd-hit groups proteins into clusters that meet a user-defined similarity threshold. cd-hit-est is similar to cd-hit, but designed to group nucleotide sequences (without introns). cd-hit-est-2d is similar to cd-hit-2d but designed to compare two nucleotide datasets. A number of other related programs are also in this package. Please see the cd-hit user manual, also part of this package, for further information.

タグ: 分野: 生物学, バイオインフォマティクス, 実装言語: implemented-in::c++, implemented-in::perl, ユーザインタフェース: コマンドライン, 役割: role::program, use::comparing, 取り扱い対象: 生物学的配列

その他の cd-hit 関連パッケージ

依存

推奨

提案

enhances

dep: libc6 (>= 2.11) [hppa]

GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

dep: libc6 (>= 2.16) [x32]

dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

dep: libc6 (>= 2.31) [sh4]

dep: libc6 (>= 2.34) [riscv64]

dep: libc6 (>= 2.7) [armel, armhf, i386, m68k, mips64el, ppc64, s390x, sparc64]
dep: libc6.1 (>= 2.31) [ia64]

GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6.1-udeb

dep: libc6.1 (>= 2.7) [alpha]
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, x32]

GCC 共有ライブラリ

dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64, sh4, sparc64]

dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386, ia64]
dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

GCC 共有ライブラリ
dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

GCC 共有ライブラリ
dep: libgomp1 (>= 6)

GCC OpenMP (GOMP) サポートライブラリ
dep: libstdc++6 (>= 13.1) [riscv64]

GNU 標準 C++ ライブラリ v3

dep: libstdc++6 (>= 5.2) [riscv64 以外]
dep: libunwind8 [ia64]

プログラムのコールチェーン測定ライブラリ - ランタイム版
dep: perl

Larry Wall 作の実用的な抽出とレポート用の言語
dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

圧縮ライブラリ - ランタイム

cd-hit のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード
アーキテクチャ	バージョン	パッケージサイズ	インストールサイズ	ファイル
alpha (非公式の移植版)	4.8.1-4	505.8 kB	1,531.0 kB	[ファイル一覧]
amd64	4.8.1-4	510.3 kB	1,411.0 kB	[ファイル一覧]
arm64	4.8.1-4	493.8 kB	1,309.0 kB	[ファイル一覧]
armel	4.8.1-4	491.0 kB	1,319.0 kB	[ファイル一覧]
armhf	4.8.1-4	487.6 kB	1,111.0 kB	[ファイル一覧]
hppa (非公式の移植版)	4.8.1-4	506.3 kB	1,398.0 kB	[ファイル一覧]
i386	4.8.1-4	511.4 kB	1,477.0 kB	[ファイル一覧]
ia64 (非公式の移植版)	4.8.1-4	525.4 kB	2,178.0 kB	[ファイル一覧]
m68k (非公式の移植版)	4.8.1-4	506.1 kB	1,423.0 kB	[ファイル一覧]
mips64el	4.8.1-4	510.9 kB	1,588.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64 (非公式の移植版)	4.8.1-4	509.0 kB	1,813.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64el	4.8.1-4	508.7 kB	1,813.0 kB	[ファイル一覧]
riscv64	4.8.1-4+b1	505.5 kB	1,236.0 kB	[ファイル一覧]
s390x	4.8.1-4	496.6 kB	1,429.0 kB	[ファイル一覧]
sh4 (非公式の移植版)	4.8.1-4	510.8 kB	1,373.0 kB	[ファイル一覧]
sparc64 (非公式の移植版)	4.8.1-4	489.5 kB	1,399.0 kB	[ファイル一覧]
x32 (非公式の移植版)	4.8.1-4	506.8 kB	1,381.0 kB	[ファイル一覧]