Пакет: bali-phy (3.6.0+dfsg-1)

Ссылки для bali-phy

Ресурсы Debian:

Исходный код bali-phy:

Сопровождающие:

Внешние ресурсы:

Сайт [www.bali-phy.org]

Подобные пакеты:

Bayesian Inference of Alignment and Phylogeny

BAli-Phy estimates multiple sequence alignments and evolutionary trees from unaligned DNA, amino acid, or codon sequences. BAli-Phy uses MCMC to estimate evolutionary trees, positive selection, and branch lengths while averaging over alternative alignments. BAli-Phy can display alignment ambiguity graphically in an alignment uncertainty (AU) plot.

BAli-Phy can also estimate phylogenies from a fixed alignment (like MrBayes and BEAST) using substitution models like GTR+gamma. BAli-Phy automatically estimates relative rates for each gene.

Другие пакеты, относящиеся к bali-phy

зависимости

рекомендации

предложения

enhances

dep: libboost-chrono1.74.0 (>= 1.74.0)

C++ representation of time duration, time point, and clocks
dep: libboost-filesystem1.74.0 (>= 1.74.0)

filesystem operations (portable paths, iteration over directories, etc) in C++
dep: libboost-program-options1.74.0 (>= 1.74.0)

program options library for C++
dep: libboost-random1.74.0 (>= 1.74.0)

Boost Random Number Library
dep: libc6 (>= 2.29)

библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb
dep: libcairo2 (>= 1.4.10)

библиотека для двухмерной векторной графики Cairo
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [s390x]

вспомогательная библиотека GCC

dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [amd64]

dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386, mipsel, ppc64el]

dep: libgcc-s1 (>= 4.5) [arm64, mips64el]
dep: libstdc++6 (>= 9)

стандартная библиотека GNU C++ версии 3
dep: perl

практический язык Ларри Уолла для извлечения данных и составления отчётов
dep: python3

интерактивный высокоуровневый объектно-ориентированный язык (версия python3 по умолчанию)

rec: gnuplot

утилита для построения графиков с интерфейсом командной строки
также виртуальный пакет, предоставляемый gnuplot-nox, gnuplot-qt, gnuplot-x11
rec: r-base

система статистических расчетов и построения графиков GNU R

sug: figtree

graphical phylogenetic tree viewer
sug: seaview

Multiplatform interface for sequence alignment and phylogeny

Загрузка bali-phy

Загрузить для всех доступных архитектур
Архитектура	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
amd64	6 034,2 Кб	35 682,0 Кб	[список файлов]
arm64	5 431,3 Кб	32 438,0 Кб	[список файлов]
armel	4 564,5 Кб	29 752,0 Кб	[список файлов]
armhf	4 260,7 Кб	22 024,0 Кб	[список файлов]
i386	5 831,4 Кб	35 044,0 Кб	[список файлов]
mips64el	5 573,4 Кб	42 247,0 Кб	[список файлов]
mipsel	5 537,4 Кб	40 464,0 Кб	[список файлов]
ppc64el	6 131,2 Кб	40 892,0 Кб	[список файлов]
s390x	4 991,8 Кб	35 522,0 Кб	[список файлов]