Пакет: libvcflib-tools (1.0.3+dfsg-2)

Ссылки для libvcflib-tools

Ресурсы Debian:

Исходный код libvcflib:

Сопровождающие:

Внешние ресурсы:

Сайт [github.com]

Подобные пакеты:

C++ library for parsing and manipulating VCF files (tools)

The Variant Call Format (VCF) is a flat-file, tab-delimited textual format intended to concisely describe reference-indexed variations between individuals. VCF provides a common interchange format for the description of variation in individuals and populations of samples, and has become the defacto standard reporting format for a wide array of genomic variant detectors.

vcflib provides methods to manipulate and interpret sequence variation as it can be described by VCF. It is both:

 * an API for parsing and operating on records of genomic variation as it can
   be described by the VCF format,
 * and a collection of command-line utilities for executing complex
   manipulations on VCF files.

This package contains several tools using the library.

Другие пакеты, относящиеся к libvcflib-tools

зависимости

рекомендации

предложения

enhances

dep: libc6 (>= 2.34)

библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb
dep: libdisorder0 (>= 0.0.2)

library for entropy measurement of byte streams
dep: libfastahack0 (>= 0.0+git20160702.bbc645f) [amd64, arm64, mips64el, ppc64el]

library for indexing and sequence extraction from FASTA files (lib)

dep: libfastahack0 (>= 1.0.0+dfsg) [не amd64, arm64, mips64el, ppc64el]
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [не armel, armhf, ppc64el]

вспомогательная библиотека GCC

dep: libgcc-s1 (>= 3.4.4) [ppc64el]

dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]
dep: libsmithwaterman0 (>= 0.0+git20160702.2610e25)

determine similar regions between two strings or genomic sequences (lib)
dep: libstdc++6 (>= 11)

стандартная библиотека GNU C++ версии 3
dep: libtabixpp0 (>= 1.0.0)

C++ wrapper to tabix indexer
dep: libvcflib1 (>= 1.0.3+dfsg)

C++ library for parsing and manipulating VCF files
dep: python3

interactive high-level object-oriented language (default python3 version)
dep: r-base-core

GNU R core of statistical computation and graphics system
dep: r-cran-ggplot2

implementation of the Grammar of Graphics
dep: r-cran-gridbase

GNU R Integration of base and grid graphics
dep: r-cran-plyr

tools for splitting, applying and combining data

sug: r-cran-pracma

practical numerical math functions for GNU R

Загрузка libvcflib-tools

Загрузить для всех доступных архитектур
Архитектура	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
amd64	730,3 Кб	4 880,0 Кб	[список файлов]
arm64	651,0 Кб	6 692,0 Кб	[список файлов]
armel	623,8 Кб	6 603,0 Кб	[список файлов]
armhf	641,6 Кб	6 219,0 Кб	[список файлов]
i386	759,9 Кб	4 915,0 Кб	[список файлов]
mips64el	645,8 Кб	7 617,0 Кб	[список файлов]
mipsel	650,6 Кб	7 253,0 Кб	[список файлов]
ppc64el	712,4 Кб	7 716,0 Кб	[список файлов]
s390x	652,4 Кб	4 620,0 Кб	[список файлов]