[ Источник: libvcflib ]
Пакет: libvcflib-tools (1.0.9+dfsg1-3 и другие)
Ссылки для libvcflib-tools
Ресурсы Debian:
- Сообщения об ошибках
- Developer Information
- Debian журнал изменений
- Файл авторских прав
- Отслеживание заплат Debian
Исходный код libvcflib:
- [libvcflib_1.0.9+dfsg1-3.dsc]
- [libvcflib_1.0.9+dfsg1.orig.tar.xz]
- [libvcflib_1.0.9+dfsg1-3.debian.tar.xz]
Сопровождающие:
Внешние ресурсы:
- Сайт [github.com]
Подобные пакеты:
C++ library for parsing and manipulating VCF files (tools)
The Variant Call Format (VCF) is a flat-file, tab-delimited textual format intended to concisely describe reference-indexed variations between individuals. VCF provides a common interchange format for the description of variation in individuals and populations of samples, and has become the defacto standard reporting format for a wide array of genomic variant detectors.
vcflib provides methods to manipulate and interpret sequence variation as it can be described by VCF. It is both:
* an API for parsing and operating on records of genomic variation as it can be described by the VCF format, * and a collection of command-line utilities for executing complex manipulations on VCF files.
This package contains several tools using the library.
Другие пакеты, относящиеся к libvcflib-tools
|
|
|
|
-
- dep: libbz2-1.0 [sparc64]
- библиотека сжатия по алгоритму Барроуза—Уилера (динамическая версия)
-
- dep: libc6 (>= 2.34) [m68k, ppc64, sparc64, x32]
- библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb
- dep: libc6 (>= 2.35) [sh4]
- dep: libc6 (>= 2.38) [amd64, arm64, mips64el, ppc64el, riscv64]
-
- dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]
- библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
также виртуальный пакет, предоставляемый libc6.1-udeb
- dep: libc6.1 (>= 2.35) [ia64]
-
- dep: libdisorder0 (>= 0.0.2)
- library for entropy measurement of byte streams
-
- dep: libfastahack0 (>= 0.0+git20160702.bbc645f) [amd64, arm64, ia64, mips64el, ppc64el, sparc64]
- library for indexing and sequence extraction from FASTA files (lib)
- dep: libfastahack0 (>= 1.0.0+dfsg) [alpha, m68k, ppc64, riscv64, sh4, x32]
-
- dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [x32]
- вспомогательная библиотека GCC
- dep: libgcc-s1 (>= 3.3.1) [amd64, arm64, mips64el, ppc64el, riscv64]
- dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, sh4, sparc64]
- dep: libgcc-s1 (>= 3.4.4) [ppc64]
- dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]
-
- dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]
- вспомогательная библиотека GCC
-
- dep: libgomp1 (>= 4.2.1) [не ia64, m68k, ppc64, sh4, x32]
- вспомогательная библиотека GCC OpenMP (GOMP)
-
- dep: libhts3 (>= 1.10) [sparc64]
- C library for high-throughput sequencing data formats
-
- dep: liblzma5 (>= 5.1.1alpha+20110809) [sparc64]
- библиотека для работы с архивами в формате XZ
-
- dep: libsmithwaterman0 (>= 0.0+git20160702.2610e25)
- determine similar regions between two strings or genomic sequences (lib)
-
- dep: libssw0 (>= 1.1) [sparc64]
- fast SIMD parallelized implementation of the Smith-Waterman algorithm
-
- dep: libstdc++6 (>= 11) [ia64, m68k, ppc64, sh4, sparc64, x32]
- стандартная библиотека GNU C++ версии 3
- dep: libstdc++6 (>= 13.1) [amd64, arm64, mips64el, ppc64el, riscv64]
- dep: libstdc++6 (>= 13.2.0-7) [alpha]
-
- dep: libtabixpp0 (>= 1.0.0) [не amd64, arm64, mips64el, ppc64el, riscv64]
- C++ wrapper to tabix indexer
-
- dep: libtabixpp0t64 (>= 1.0.0) [amd64, arm64, mips64el, ppc64el, riscv64]
- C++ wrapper to tabix indexer
-
- dep: libunwind8 [ia64]
- библиотека для выявления цепочки вызовов функций в программе
-
- dep: libvcflib1 (>= 1.0.3+dfsg) [ia64, m68k, ppc64, sh4, sparc64, x32]
- C++ library for parsing and manipulating VCF files
-
- dep: libvcflib2 (>= 1.0.9+dfsg1) [alpha, amd64, arm64, mips64el, ppc64el, riscv64]
- C++ library for parsing and manipulating VCF files
-
- dep: libwfa2-0 (>= 2.3.3) [alpha, amd64, arm64, mips64el, ppc64el, riscv64]
- exact gap-affine algorithm (shared library)
-
- dep: python3
- interactive high-level object-oriented language (default python3 version)
-
- dep: r-base-core
- GNU R core of statistical computation and graphics system
-
- dep: r-cran-ggplot2
- implementation of the Grammar of Graphics
-
- dep: r-cran-gridbase
- GNU R Integration of base and grid graphics
-
- dep: r-cran-plyr
- tools for splitting, applying and combining data
-
- dep: zlib1g (>= 1:1.1.4) [sparc64]
- библиотека сжатия
-
- sug: r-cran-pracma
- practical numerical math functions for GNU R
Загрузка libvcflib-tools
| Архитектура | Версия | Размер пакета | В установленном виде | Файлы |
|---|---|---|---|---|
| alpha (неофициальный перенос) | 1.0.9+dfsg1-3 | 613,1 Кб | 6 870,0 Кб | [список файлов] |
| amd64 | 1.0.9+dfsg1-3+b3 | 651,4 Кб | 3 918,0 Кб | [список файлов] |
| arm64 | 1.0.9+dfsg1-3+b3 | 584,9 Кб | 6 594,0 Кб | [список файлов] |
| ia64 (неофициальный перенос) | 1.0.3+dfsg-2 | 853,2 Кб | 8 189,0 Кб | [список файлов] |
| m68k (неофициальный перенос) | 1.0.3+dfsg-2 | 711,2 Кб | 4 531,0 Кб | [список файлов] |
| mips64el | 1.0.9+dfsg1-3+b3 | 617,6 Кб | 6 925,0 Кб | [список файлов] |
| ppc64 (неофициальный перенос) | 1.0.3+dfsg-2 | 707,1 Кб | 8 228,0 Кб | [список файлов] |
| ppc64el | 1.0.9+dfsg1-3+b3 | 637,4 Кб | 6 850,0 Кб | [список файлов] |
| riscv64 | 1.0.9+dfsg1-3+b3 | 620,1 Кб | 2 942,0 Кб | [список файлов] |
| sh4 (неофициальный перенос) | 1.0.3+dfsg-2 | 808,7 Кб | 6 691,0 Кб | [список файлов] |
| sparc64 (неофициальный перенос) | 1.0.3+dfsg-2 | 816,8 Кб | 91 827,0 Кб | [список файлов] |
| x32 (неофициальный перенос) | 1.0.3+dfsg-2 | 729,6 Кб | 4 483,0 Кб | [список файлов] |