Pakiet: gmap (2024-05-20+ds-1)

Odnośniki dla gmap

Zasoby systemu Debian:

Pobieranie pakietu źródłowego gmap:

Opiekunowie:

Zasoby zewnętrzne:

Strona internetowa [research-pub.gene.com]

Podobne pakiety:

Dopasowanie splicingowe i tolerancyjne SNP dla mRNA i krótkich odczytów

Pakiet ten zawiera programy GMAP i GSNAP oraz narzędzia do zarządzania bazami danych genomów w formacie GMAP/GSNAP. GMAP (Genomic Mapping and Alignment Program) to narzędzie służące do dopasowywania sekwencji EST, mRNA i cDNA. GSNAP (Genomic Short-read Nucleotide Alignment Program) to narzędzie do dopasowywania odczytów transkryptomu z pojedynczym i sparowanym końcem. Obydwa narzędzia mogą korzystać z bazy danych:

 * znanych miejsc splotów i zidentyfikować nowe tego typu miejsca.
 * znanych polimorfizmów pojedynczych nukleotydów (SNP).

GSNAP może wyrównać DNA poddanemu działaniu wodorosiarczynu.

Znaczniki: Dziedzina: Biologia, field::biology:bioinformatics, field::biology:structural, Rola: Program, Przeznaczenie: Analizowanie

Inne pakiety związane z gmap

wymaga

poleca

sugeruje

enhances

dep: libbz2-1.0

Wysokiej jakości biblioteka kompresji plików - wersja uruchomieniowa
dep: libc6 (>= 2.34) [nie sh4]

Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]
dep: perl

praktyczny język ekstrakcji i raportowania Larry'ego Walla
dep: zlib1g (>= 1:1.2.6)

Biblioteka kompresyjna - pliki wykonawcze

Pobieranie gmap

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur
Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
amd64	32 246,6 KiB	253 490,0 KiB	[lista plików]
arm64	6 244,2 KiB	58 942,0 KiB	[lista plików]
armel	4 824,3 KiB	44 107,0 KiB	[lista plików]
armhf	5 383,8 KiB	41 971,0 KiB	[lista plików]
i386	5 559,4 KiB	44 303,0 KiB	[lista plików]
mips64el	5 035,7 KiB	55 487,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	6 436,0 KiB	61 438,0 KiB	[lista plików]
riscv64	6 215,8 KiB	57 262,0 KiB	[lista plików]
sh4 (port nieoficjalny)	5 648,4 KiB	46 446,0 KiB	[lista plików]
x32 (port nieoficjalny)	5 422,1 KiB	45 815,0 KiB	[lista plików]