Pakiet: gmap (2021-12-17+ds-3)

Odnośniki dla gmap

Zasoby systemu Debian:

Pobieranie pakietu źródłowego gmap:

Opiekunowie:

Zasoby zewnętrzne:

Strona internetowa [research-pub.gene.com]

Podobne pakiety:

Dopasowanie splicingowe i tolerancyjne SNP dla mRNA i krótkich odczytów

Pakiet ten zawiera programy GMAP i GSNAP oraz narzędzia do zarządzania bazami danych genomów w formacie GMAP/GSNAP. GMAP (Genomic Mapping and Alignment Program) to narzędzie służące do dopasowywania sekwencji EST, mRNA i cDNA. GSNAP (Genomic Short-read Nucleotide Alignment Program) to narzędzie do dopasowywania odczytów transkryptomu z pojedynczym i sparowanym końcem. Obydwa narzędzia mogą korzystać z bazy danych:

 * znanych miejsc splotów i zidentyfikować nowe tego typu miejsca.
 * znanych polimorfizmów pojedynczych nukleotydów (SNP).

GSNAP może wyrównać DNA poddanemu działaniu wodorosiarczynu.

Znaczniki: Dziedzina: Biologia, field::biology:bioinformatics, field::biology:structural, Rola: Program, Przeznaczenie: Analizowanie

Inne pakiety związane z gmap

wymaga

poleca

sugeruje

enhances

dep: libbz2-1.0

Wysokiej jakości biblioteka kompresji plików - wersja uruchomieniowa
dep: libc6 (>= 2.34)

Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb
dep: perl

praktyczny język ekstrakcji i raportowania Larry'ego Walla
dep: zlib1g (>= 1:1.2.6)

Biblioteka kompresyjna - pliki wykonawcze

Pobieranie gmap

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur
Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
amd64	11 077,9 KiB	89 482,0 KiB	[lista plików]
arm64	6 950,3 KiB	58 950,0 KiB	[lista plików]
armel	5 407,5 KiB	44 524,0 KiB	[lista plików]
armhf	5 788,3 KiB	42 476,0 KiB	[lista plików]
i386	6 086,9 KiB	43 904,0 KiB	[lista plików]
mips64el	5 331,8 KiB	55 440,0 KiB	[lista plików]
mipsel	5 324,2 KiB	46 108,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	7 299,8 KiB	60 998,0 KiB	[lista plików]