[ Pakiet źródłowy: htslib ]
Pakiet: tabix (1.11-4)
Odnośniki dla tabix
Zasoby systemu Debian:
- Raporty o błędach
- Developer Information
- Dziennik zmian w systemie Debian
- Informacje nt. praw autorskich
- Śledzenie łatek systemu Debian
Pobieranie pakietu źródłowego htslib:
Opiekunowie:
- Debian Med Packaging Team (Strona QA, Archiwum e-mail)
- Charles Plessy (Strona QA)
- Andreas Tille (Strona QA)
- Michael R. Crusoe (Strona QA)
- Steffen Moeller (Strona QA)
Zasoby zewnętrzne:
- Strona internetowa [github.com]
Podobne pakiety:
Narzędzie do indeksowania plików z tabulacjami rozdzielającymi pozycje genomu
Tabix indeksuje pliki, w których kolejność współrzędnych jest wskazywana przez niektóre kolumny, takie jak: name (zwykle z nazwą chromosomu), start i stop. Plik z danymi wejściowymi powinien być posortowany pod kątem pozycji (genomów) oraz skompresowany przy użyciu programu bgzip (dostarczonego w tym pakiecie), oferującego interfejs podobny do gzip. Po wykonaniu operacji indeksowania, Tabix może szybko wyszukiwać linie danych według współrzędnych chromosomalnych. Szybkie wyszukiwanie danych działa także za pośrednictwem sieci, jeśli URI jest podany jako nazwa pliku.
Do budowy pakietu wykorzystano kod źródłowy HTSlib. Pakiet zawiera następujące narzędzia: bgzip, htsfile i tabix.
Inne pakiety związane z tabix
|
|
|
|
-
- dep: libbz2-1.0
- Wysokiej jakości biblioteka kompresji plików - wersja uruchomieniowa
-
- dep: libc6 (>= 2.15) [nie arm64, ppc64el]
- Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb
- dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]
-
- dep: libdeflate0 (>= 1.0)
- Szybka kompresja i dekompresja oparta na całym buforze DEFLATE
-
- dep: liblzma5 (>= 5.1.1alpha+20120614)
- Biblioteka do kompresji w formacie XZ
-
- dep: zlib1g (>= 1:1.2.0)
- Biblioteka kompresyjna - pliki wykonawcze
Pobieranie tabix
| Architektura | Rozmiar pakietu | Rozmiar po instalacji | Pliki |
|---|---|---|---|
| amd64 | 330,7 KiB | 1 087,0 KiB | [lista plików] |
| arm64 | 308,5 KiB | 1 011,0 KiB | [lista plików] |
| armel | 293,1 KiB | 1 004,0 KiB | [lista plików] |
| armhf | 298,7 KiB | 728,0 KiB | [lista plików] |
| i386 | 360,7 KiB | 1 200,0 KiB | [lista plików] |
| mips64el | 312,8 KiB | 1 240,0 KiB | [lista plików] |
| mipsel | 327,7 KiB | 1 215,0 KiB | [lista plików] |
| ppc64el | 358,6 KiB | 1 467,0 KiB | [lista plików] |
| s390x | 301,7 KiB | 1 151,0 KiB | [lista plików] |