[ Paquet source : htslib ]
Paquet : tabix (1.11-4)
Liens pour tabix
Ressources Debian :
- Rapports de bogues
- Developer Information
- Journal des modifications Debian
- Fichier de licence
- Suivis des correctifs pour Debian
Télécharger le paquet source htslib :
Responsables :
- Debian Med Packaging Team (Page QA, Archive du courrier électronique)
- Charles Plessy (Page QA)
- Andreas Tille (Page QA)
- Michael R. Crusoe (Page QA)
- Steffen Moeller (Page QA)
Ressources externes :
- Page d'accueil [github.com]
Paquets similaires :
indexeur générique pour fichiers de positions de génome, délimités par des tabulations
Tabix indexe des fichiers où certaines colonnes indiquent les coordonnées de séquence : nom (habituellement un chromosome), départ et fin. Le fichier de données d'entrée doit être trié en fonction du positionnement et compressé par bgzip (fourni dans ce paquet), qui a une interface similaire à celle de gzip. Après indexation, tabix est en mesure de récupérer rapidement les lignes de données par coordonnées chromosomiques. La récupération rapide des données fonctionne aussi sur le réseau si une URI est donnée comme nom de fichier.
Ce paquet a été compilé à partir du code source de HTSlib et fournit les outils bgzip, htsfile et tabix.
Autres paquets associés à tabix
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- dep: libbz2-1.0
- Bibliothèque de compression de fichiers (tri de block haute qualité)
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- dep: libc6 (>= 2.15) [non arm64, ppc64el]
- bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb
- dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]
-
- dep: libdeflate0 (>= 1.0)
- compression et décompression de tampon complet rapide basée sur DEFLATE
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- dep: liblzma5 (>= 5.1.1alpha+20120614)
- librairie de compression au format XZ
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- dep: zlib1g (>= 1:1.2.0)
- Bibliothèque de compression - binaires
Télécharger tabix
| Architecture | Taille du paquet | Espace occupé une fois installé | Fichiers |
|---|---|---|---|
| amd64 | 330,7 ko | 1 087,0 ko | [liste des fichiers] |
| arm64 | 308,5 ko | 1 011,0 ko | [liste des fichiers] |
| armel | 293,1 ko | 1 004,0 ko | [liste des fichiers] |
| armhf | 298,7 ko | 728,0 ko | [liste des fichiers] |
| i386 | 360,7 ko | 1 200,0 ko | [liste des fichiers] |
| mips64el | 312,8 ko | 1 240,0 ko | [liste des fichiers] |
| mipsel | 327,7 ko | 1 215,0 ko | [liste des fichiers] |
| ppc64el | 358,6 ko | 1 467,0 ko | [liste des fichiers] |
| s390x | 301,7 ko | 1 151,0 ko | [liste des fichiers] |