Pakiet: tabix (1.16+ds-3)

Odnośniki dla tabix

Zasoby systemu Debian:

Pobieranie pakietu źródłowego htslib:

Opiekunowie:

Debian Med Packaging Team (Strona QA, Archiwum e-mail)
Charles Plessy (Strona QA)
Andreas Tille (Strona QA)
Michael R. Crusoe (Strona QA)
Steffen Moeller (Strona QA)
Étienne Mollier (Strona QA)

Zasoby zewnętrzne:

Strona internetowa [github.com]

Podobne pakiety:

Narzędzie do indeksowania plików z tabulacjami rozdzielającymi pozycje genomu

Tabix indeksuje pliki, w których kolejność współrzędnych jest wskazywana przez niektóre kolumny, takie jak: name (zwykle z nazwą chromosomu), start i stop. Plik z danymi wejściowymi powinien być posortowany pod kątem pozycji (genomów) oraz skompresowany przy użyciu programu bgzip (dostarczonego w tym pakiecie), oferującego interfejs podobny do gzip. Po wykonaniu operacji indeksowania, Tabix może szybko wyszukiwać linie danych według współrzędnych chromosomalnych. Szybkie wyszukiwanie danych działa także za pośrednictwem sieci, jeśli URI jest podany jako nazwa pliku.

Do budowy pakietu wykorzystano kod źródłowy HTSlib. Pakiet zawiera następujące narzędzia: bgzip, htsfile i tabix.

Znaczniki: Zaimplementowane w: C, Rola: Program, Nauka: science::calculation, use::calculating, Obsługa formatu: HTML - Hypertext Markup Language, Działa z: Tekst

Inne pakiety związane z tabix

wymaga

poleca

sugeruje

enhances

dep: libbz2-1.0

Wysokiej jakości biblioteka kompresji plików - wersja uruchomieniowa
dep: libc6 (>= 2.34)

Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb
dep: libdeflate0 (>= 1.0)

Szybka kompresja i dekompresja oparta na całym buforze DEFLATE
dep: libhtscodecs2 (>= 1.3.0)

Custom compression for CRAM and others
dep: liblzma5 (>= 5.1.1alpha+20120614)

Biblioteka do kompresji w formacie XZ
dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

Biblioteka kompresyjna - pliki wykonawcze

Pobieranie tabix

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur
Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
amd64	446,3 KiB	2 185,0 KiB	[lista plików]
arm64	417,1 KiB	2 177,0 KiB	[lista plików]
armel	378,0 KiB	2 046,0 KiB	[lista plików]
armhf	378,6 KiB	1 534,0 KiB	[lista plików]
i386	489,4 KiB	2 478,0 KiB	[lista plików]
mips64el	411,8 KiB	2 541,0 KiB	[lista plików]
mipsel	425,5 KiB	2 532,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	481,2 KiB	2 945,0 KiB	[lista plików]
s390x	404,3 KiB	2 293,0 KiB	[lista plików]