Pakiet: tabix (1.9-12~deb10u1)

Odnośniki dla tabix

Zasoby systemu Debian:

Pobieranie pakietu źródłowego htslib:

Opiekunowie:

Zasoby zewnętrzne:

Strona internetowa [github.com]

Podobne pakiety:

Narzędzie do indeksowania plików z tabulacjami rozdzielającymi pozycje genomu

Tabix indeksuje pliki, w których kolejność współrzędnych jest wskazywana przez niektóre kolumny, takie jak: name (zwykle z nazwą chromosomu), start i stop. Plik z danymi wejściowymi powinien być posortowany pod kątem pozycji (genomów) oraz skompresowany przy użyciu programu bgzip (dostarczonego w tym pakiecie), oferującego interfejs podobny do gzip. Po wykonaniu operacji indeksowania, Tabix może szybko wyszukiwać linie danych według współrzędnych chromosomalnych. Szybkie wyszukiwanie danych działa także za pośrednictwem sieci, jeśli URI jest podany jako nazwa pliku.

Ta wersja programu Tabix została skompilowana z kodu źródłowego HTSlib.

Znaczniki: Zaimplementowane w: C, Rola: Program, Nauka: science::calculation, use::calculating, Obsługa formatu: HTML - Hypertext Markup Language, Działa z: Tekst

Inne pakiety związane z tabix

wymaga

poleca

sugeruje

enhances

dep: libbz2-1.0

Wysokiej jakości biblioteka kompresji plików - wersja uruchomieniowa
dep: libc6 (>= 2.15) [nie arm64]

Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.17) [arm64]
dep: libcurl3-gnutls (>= 7.18.0)

Łatwa w użyciu biblioteka klienta do transferu adresów URL (wersja GnuTLS)
dep: libdeflate0 (>= 1.0)

Szybka kompresja i dekompresja oparta na całym buforze DEFLATE
dep: liblzma5 (>= 5.1.1alpha+20120614)

Biblioteka do kompresji w formacie XZ
dep: libssl1.1 (>= 1.1.0)

Zestaw narzędzi Secure Sockets Layer - biblioteki współdzielone
dep: zlib1g (>= 1:1.2.0)

Biblioteka kompresyjna - pliki wykonawcze

Pobieranie tabix

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur
Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
amd64	284,8 KiB	979,0 KiB	[lista plików]
arm64	265,5 KiB	883,0 KiB	[lista plików]
armhf	256,2 KiB	616,0 KiB	[lista plików]
i386	312,5 KiB	1 072,0 KiB	[lista plików]