Pakiet: bali-phy (3.6.0+dfsg-1)

Odnośniki dla bali-phy

Zasoby systemu Debian:

Pobieranie pakietu źródłowego bali-phy:

Opiekunowie:

Zasoby zewnętrzne:

Strona internetowa [www.bali-phy.org]

Podobne pakiety:

Bayesian Inference of Alignment and Phylogeny

BAli-Phy estimates multiple sequence alignments and evolutionary trees from unaligned DNA, amino acid, or codon sequences. BAli-Phy uses MCMC to estimate evolutionary trees, positive selection, and branch lengths while averaging over alternative alignments. BAli-Phy can display alignment ambiguity graphically in an alignment uncertainty (AU) plot.

BAli-Phy can also estimate phylogenies from a fixed alignment (like MrBayes and BEAST) using substitution models like GTR+gamma. BAli-Phy automatically estimates relative rates for each gene.

Inne pakiety związane z bali-phy

wymaga

poleca

sugeruje

enhances

dep: libboost-chrono1.74.0 (>= 1.74.0)

C++ representation of time duration, time point, and clocks
dep: libboost-filesystem1.74.0 (>= 1.74.0)

filesystem operations (portable paths, iteration over directories, etc) in C++
dep: libboost-program-options1.74.0 (>= 1.74.0)

program options library for C++
dep: libboost-random1.74.0 (>= 1.74.0)

Boost Random Number Library
dep: libc6 (>= 2.29)

Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb
dep: libcairo2 (>= 1.4.10)

Cairo - biblioteka do dwuwymiarowej grafiki wektorowej
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [s390x]

Biblioteka wspomagająca GCC

dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [amd64]

dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386, mipsel, ppc64el]

dep: libgcc-s1 (>= 4.5) [arm64, mips64el]
dep: libstdc++6 (>= 9)

Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3
dep: perl

praktyczny język ekstrakcji i raportowania Larry'ego Walla
dep: python3

interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

rec: gnuplot

Interaktywny program do tworzenia wykresów, sterowany z wiersza poleceń
również pakiet wirtualny udostępniany przez gnuplot-nox, gnuplot-qt, gnuplot-x11
rec: r-base

System GNU R do obliczeń statystycznych i prezentacji danych w formie graficznej

sug: figtree

Graficzna przeglądarka drzew filogenetycznych
sug: seaview

Multiplatform interface for sequence alignment and phylogeny

Pobieranie bali-phy

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur
Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
amd64	6 034,2 KiB	35 682,0 KiB	[lista plików]
arm64	5 431,3 KiB	32 438,0 KiB	[lista plików]
armel	4 564,5 KiB	29 752,0 KiB	[lista plików]
armhf	4 260,7 KiB	22 024,0 KiB	[lista plików]
i386	5 831,4 KiB	35 044,0 KiB	[lista plików]
mips64el	5 573,4 KiB	42 247,0 KiB	[lista plików]
mipsel	5 537,4 KiB	40 464,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	6 131,2 KiB	40 892,0 KiB	[lista plików]
s390x	4 991,8 KiB	35 522,0 KiB	[lista plików]