[ ソース: spaln ]
パッケージ: spaln (2.4.1+dfsg-3)
spaln に関するリンク
Debian の資源:
spaln ソースパッケージをダウンロード:
メンテナ:
外部の資源:
- ホームページ [www.genome.ist.i.kyoto-u.ac.jp]
類似のパッケージ:
splicing-aware transcript-alignment to genomic DNA
Spaln (space-efficient spliced alignment) is a stand-alone program that maps and aligns a set of cDNA or protein sequences onto a whole genomic sequence in a single job. It also performs spliced or ordinary alignment after rapid similarity search against a protein sequence database, if a genomic segment or an amino acid sequence is given as a query.
spaln supports a combination of protein sequence database and a given genomic segment and performs rapid similarity searches and (semi-)global alignments of a set of protein sequence queries against a protein sequence database. Spaln adopts multi-phase heuristics that makes it possible to perform the job on a conventional personal computer.
その他の spaln 関連パッケージ
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- dep: libc6 (>= 2.29)
- GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb
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- dep: libgcc-s1 (>= 3.3.1) [armel, armhf 以外]
- GCC 共有ライブラリ
- dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]
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- dep: libstdc++6 (>= 5)
- GNU 標準 C++ ライブラリ v3
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- dep: spaln-data
- splicing-aware transcript-alignment to genomic DNA (data)
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- dep: zlib1g (>= 1:1.2.0.2)
- 圧縮ライブラリ - ランタイム
spaln のダウンロード
| アーキテクチャ | パッケージサイズ | インストールサイズ | ファイル |
|---|---|---|---|
| amd64 | 345.1 kB | 855.0 kB | [ファイル一覧] |
| arm64 | 311.5 kB | 775.0 kB | [ファイル一覧] |
| armel | 296.6 kB | 781.0 kB | [ファイル一覧] |
| armhf | 303.3 kB | 589.0 kB | [ファイル一覧] |
| i386 | 349.5 kB | 881.0 kB | [ファイル一覧] |
| mips64el | 330.2 kB | 955.0 kB | [ファイル一覧] |
| mipsel | 323.5 kB | 895.0 kB | [ファイル一覧] |
| ppc64el | 360.1 kB | 1,120.0 kB | [ファイル一覧] |
| s390x | 349.1 kB | 1,003.0 kB | [ファイル一覧] |