Pakiet: spaln (2.4.1+dfsg-3)

Odnośniki dla spaln

Zasoby systemu Debian:

Pobieranie pakietu źródłowego spaln:

Opiekunowie:

Zasoby zewnętrzne:

Strona internetowa [www.genome.ist.i.kyoto-u.ac.jp]

Podobne pakiety:

splicing-aware transcript-alignment to genomic DNA

Spaln (space-efficient spliced alignment) is a stand-alone program that maps and aligns a set of cDNA or protein sequences onto a whole genomic sequence in a single job. It also performs spliced or ordinary alignment after rapid similarity search against a protein sequence database, if a genomic segment or an amino acid sequence is given as a query.

spaln supports a combination of protein sequence database and a given genomic segment and performs rapid similarity searches and (semi-)global alignments of a set of protein sequence queries against a protein sequence database. Spaln adopts multi-phase heuristics that makes it possible to perform the job on a conventional personal computer.

Inne pakiety związane z spaln

wymaga

poleca

sugeruje

enhances

dep: libc6 (>= 2.29)

Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb
dep: libgcc-s1 (>= 3.3.1) [nie armel, armhf]

Biblioteka wspomagająca GCC

dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]
dep: libstdc++6 (>= 5)

Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3
dep: spaln-data

splicing-aware transcript-alignment to genomic DNA (data)
dep: zlib1g (>= 1:1.2.0.2)

Biblioteka kompresyjna - pliki wykonawcze

Pobieranie spaln

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur
Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
amd64	345,1 KiB	855,0 KiB	[lista plików]
arm64	311,5 KiB	775,0 KiB	[lista plików]
armel	296,6 KiB	781,0 KiB	[lista plików]
armhf	303,3 KiB	589,0 KiB	[lista plików]
i386	349,5 KiB	881,0 KiB	[lista plików]
mips64el	330,2 KiB	955,0 KiB	[lista plików]
mipsel	323,5 KiB	895,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	360,1 KiB	1 120,0 KiB	[lista plików]
s390x	349,1 KiB	1 003,0 KiB	[lista plików]