[ Source: spaln ]
Пакунок: spaln (2.4.1+dfsg-3)
Links for spaln
Debian Resources:
Download Source Package spaln:
Maintainers:
External Resources:
- Homepage [www.genome.ist.i.kyoto-u.ac.jp]
Similar packages:
splicing-aware transcript-alignment to genomic DNA
Spaln (space-efficient spliced alignment) is a stand-alone program that maps and aligns a set of cDNA or protein sequences onto a whole genomic sequence in a single job. It also performs spliced or ordinary alignment after rapid similarity search against a protein sequence database, if a genomic segment or an amino acid sequence is given as a query.
spaln supports a combination of protein sequence database and a given genomic segment and performs rapid similarity searches and (semi-)global alignments of a set of protein sequence queries against a protein sequence database. Spaln adopts multi-phase heuristics that makes it possible to perform the job on a conventional personal computer.
Інші пакунки пов'язані з spaln
|
|
|
|
-
- dep: libc6 (>= 2.29)
- Бібліотека GNU C: спільні бібліотеки
also a virtual package provided by libc6-udeb
-
- dep: libgcc-s1 (>= 3.3.1) [not armel, armhf]
- Допоміжна бібліотека GCC
- dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]
-
- dep: libstdc++6 (>= 5)
- Стандартна бібліотека C++ GNU, версії 3
-
- dep: spaln-data
- splicing-aware transcript-alignment to genomic DNA (data)
-
- dep: zlib1g (>= 1:1.2.0.2)
- Бібліотека стискання даних (виконавчий модуль)
Завантажити spaln
| Архітектура | Розмір пакунка | Розмір після встановлення | Файли |
|---|---|---|---|
| amd64 | 345.1 kB | 855.0 kB | [список файлів] |
| arm64 | 311.5 kB | 775.0 kB | [список файлів] |
| armel | 296.6 kB | 781.0 kB | [список файлів] |
| armhf | 303.3 kB | 589.0 kB | [список файлів] |
| i386 | 349.5 kB | 881.0 kB | [список файлів] |
| mips64el | 330.2 kB | 955.0 kB | [список файлів] |
| mipsel | 323.5 kB | 895.0 kB | [список файлів] |
| ppc64el | 360.1 kB | 1,120.0 kB | [список файлів] |
| s390x | 349.1 kB | 1,003.0 kB | [список файлів] |