all options
bullseye  ] [  bookworm  ] [  trixie  ] [  sid  ]
[ Source: spaln  ]

Пакунок: spaln (2.4.1+dfsg-3)

Links for spaln

Screenshot

Debian Resources:

Download Source Package spaln:

Maintainers:

External Resources:

Similar packages:

splicing-aware transcript-alignment to genomic DNA

Spaln (space-efficient spliced alignment) is a stand-alone program that maps and aligns a set of cDNA or protein sequences onto a whole genomic sequence in a single job. It also performs spliced or ordinary alignment after rapid similarity search against a protein sequence database, if a genomic segment or an amino acid sequence is given as a query.

spaln supports a combination of protein sequence database and a given genomic segment and performs rapid similarity searches and (semi-)global alignments of a set of protein sequence queries against a protein sequence database. Spaln adopts multi-phase heuristics that makes it possible to perform the job on a conventional personal computer.

Інші пакунки пов'язані з spaln

  • depends
  • recommends
  • suggests
  • enhances

Завантажити spaln

Завантаження для всіх доступних архітектур
Архітектура Розмір пакунка Розмір після встановлення Файли
amd64 345.1 kB855.0 kB [список файлів]
arm64 311.5 kB775.0 kB [список файлів]
armel 296.6 kB781.0 kB [список файлів]
armhf 303.3 kB589.0 kB [список файлів]
i386 349.5 kB881.0 kB [список файлів]
mips64el 330.2 kB955.0 kB [список файлів]
mipsel 323.5 kB895.0 kB [список файлів]
ppc64el 360.1 kB1,120.0 kB [список файлів]
s390x 349.1 kB1,003.0 kB [список файлів]