パッケージ: boxshade (3.3.1-14)

boxshade に関するリンク

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boxshade ソースパッケージをダウンロード:

メンテナ:

外部の資源:

ホームページ [www.ch.embnet.org]

類似のパッケージ:

多重配列アライメントのプリティプリンティング

Boxshade はマルチプルアライメントされたタンパク質または DNA 配列のきれいなプリントアウトを生成するプログラムです。このプログラム自身はアライメントを行いませんので、入力ファイルとして、マルチプルアライメントプログラムが作成したか、または個々のツールで手動編集したファイルが必要です。

Boxshade はマルチプルアライメントされた配列を PILEUP-MSF, CLUSTAL-ALN, MALIGNED-data および ESEE-save ファイルから読み込みます (最大 150 配列まで、各配列は最大 10000 エレメントまでの制限があります) 。各種シェーディングを一致する/類似の残基に適用できます。出力は画面に表示するか、または以下のフォーマットによりファイルに出力できます: ANSI/VT100, PS/EPS, RTF, HPGL, ReGIS, LJ-250-printer, ASCII, xFIG, PICT, HTML

タグ: 生物学: Clustal/ALN, タンパク質, 分野: field::biology, field::biology:bioinformatics, 実装言語: implemented-in::c, interface::commandline, 役割: プログラム, 対象範囲: scope::utility, use::typesetting, サポート形式: works-with-format::html, works-with-format::plaintext, works-with-format::postscript, works-with-format::tex, 取り扱い対象: 追加のタグが必要, テキスト

その他の boxshade 関連パッケージ

依存

推奨

提案

enhances

dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

dep: libc6 (>= 2.7) [amd64, arm64, ppc64el 以外]

sug: kalign

グローバルおよびプログレッシブ多重配列アライメント

または clustalw

global multiple nucleotide or peptide sequence alignment

または mafft

Multiple alignment program for amino acid or nucleotide sequences

または hmmer

タンパク質配列解析用のプロファイル隠れマルコフモデル
sug: seaview

Multiplatform interface for sequence alignment and phylogeny
sug: texlive-latex-extra

TeX Live: LaTeX additional packages
sug: xfig

Facility for Interactive Generation of figures under X11

boxshade のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード
アーキテクチャ	パッケージサイズ	インストールサイズ	ファイル
amd64	54.5 kB	161.0 kB	[ファイル一覧]
arm64	53.1 kB	160.0 kB	[ファイル一覧]
armel	54.6 kB	163.0 kB	[ファイル一覧]
armhf	52.9 kB	135.0 kB	[ファイル一覧]
i386	56.0 kB	176.0 kB	[ファイル一覧]
mips64el	53.3 kB	187.0 kB	[ファイル一覧]
mipsel	52.9 kB	173.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64el	56.4 kB	193.0 kB	[ファイル一覧]
s390x	52.9 kB	168.0 kB	[ファイル一覧]