Pakiet: boxshade (3.3.1-14)

Odnośniki dla boxshade

Zasoby systemu Debian:

Pobieranie pakietu źródłowego boxshade:

Opiekunowie:

Zasoby zewnętrzne:

Strona internetowa [www.ch.embnet.org]

Podobne pakiety:

Pretty-printing of multiple sequence alignments

Boxshade is a program for creating good looking printouts from multiple-aligned protein or DNA sequences. The program does not perform the alignment by itself and requires as input a file that was created by a multiple alignment program or manually edited with respective tools.

Boxshade reads multiple-aligned sequences from either PILEUP-MSF, CLUSTAL-ALN, MALIGNED-data and ESEE-save files (limited to a maximum of 150 sequences with up to 10000 elements each). Various kinds of shading can be applied to identical/similar residues. Output is written to screen or to a file in the following formats: ANSI/VT100, PS/EPS, RTF, HPGL, ReGIS, LJ250-printer, ASCII, xFIG, PICT, HTML

Znaczniki: Biologia: Clustal/ALN, Białka, Dziedzina: field::biology, field::biology:bioinformatics, Zaimplementowane w: implemented-in::c, interface::commandline, Rola: Program, Zakres: scope::utility, use::typesetting, Obsługa formatu: works-with-format::html, works-with-format::plaintext, works-with-format::postscript, works-with-format::tex, Działa z: Wymaga dodatkowego znacznika, Tekst

Inne pakiety związane z boxshade

wymaga

poleca

sugeruje

enhances

dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

dep: libc6 (>= 2.7) [nie amd64, arm64, ppc64el]

sug: kalign

Globalne i progresywne dopasowywanie wielu sekwencji

lub clustalw

global multiple nucleotide or peptide sequence alignment

lub mafft

Multiple alignment program for amino acid or nucleotide sequences

lub hmmer

profile hidden Markov models for protein sequence analysis
sug: seaview

Multiplatform interface for sequence alignment and phylogeny
sug: texlive-latex-extra

TeX Live: LaTeX additional packages
sug: xfig

Narzędzie do interaktywnego tworzenia rysunków w środowisku X11

Pobieranie boxshade

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur
Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
amd64	54,5 KiB	161,0 KiB	[lista plików]
arm64	53,1 KiB	160,0 KiB	[lista plików]
armel	54,6 KiB	163,0 KiB	[lista plików]
armhf	52,9 KiB	135,0 KiB	[lista plików]
i386	56,0 KiB	176,0 KiB	[lista plików]
mips64el	53,3 KiB	187,0 KiB	[lista plików]
mipsel	52,9 KiB	173,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	56,4 KiB	193,0 KiB	[lista plików]
s390x	52,9 KiB	168,0 KiB	[lista plików]