Package: boxshade (3.3.1-14)

Links for boxshade

Debian Resources:

Download Source Package boxshade:

Maintainers:

Debian Med Packaging Team (QA Page, Mail Archive)
Steffen Moeller (QA Page)
Charles Plessy (QA Page)
Andreas Tille (QA Page)

External Resources:

Homepage [www.ch.embnet.org]

Similar packages:

Pæn udskrift af flere sekvensersammenstillinger

Boxshade er et program til at lave flotte udskrifter fra flere protein- eller DNA-sekvensersammenstillinger. Programmet udfører ikke selv sammenstillingerne og kræver som inddata en fil, som er oprettet af et program til sekvenssammenstilling eller manuelt redigeret med respektive værktøjer.

Boxshade læser flere sekvenssammenstillinger fra PILEUP-MSF, CLUSTAL- ALN, MALIGNED-data og ESEE-save filer (begrænset til et maksimum af 150 sekvenser med op til 10000 elementer i hver). Adskillige slags skygger kan påføres på identitiske/lignende restkoncentrationer. Uddata skrives til skærm eller til en fil i følgende formater: ANSI/VT100, PS/EPS, RTF, HPGL, ReGIS, LJ250-printer, ASCII, xFIG, PICT, HTML

Tags: Biology: Clustal/ALN, Proteins, Field: field::biology, field::biology:bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c, interface::commandline, Role: Program, Scope: scope::utility, use::typesetting, Supports Format: works-with-format::html, works-with-format::plaintext, works-with-format::postscript, works-with-format::tex, Works with: Need an extra tag, Text

Other Packages Related to boxshade

depends

recommends

suggests

enhances

dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
also a virtual package provided by libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

dep: libc6 (>= 2.7) [not amd64, arm64, ppc64el]

sug: kalign

Global og progressiv flersekvensjustering

or clustalw

Global nukleotid eller peptid sekvensjustering

or mafft

Program til justering af flere aminosyrer eller nukleotide sekvenser

or hmmer

Profilskjulte Markov-modeller for proteinsekvensanalyse
sug: seaview

Grænseflade til flere platforme for sekvenssammenligning og fylogeni
sug: texlive-latex-extra

Tex Live - yderligere LaTeX-pakker
sug: xfig

Interaktiv tegning af figurer under X11

Download boxshade

Download for all available architectures
Architecture	Package Size	Installed Size	Files
amd64	54.5 kB	161.0 kB	[list of files]
arm64	53.1 kB	160.0 kB	[list of files]
armel	54.6 kB	163.0 kB	[list of files]
armhf	52.9 kB	135.0 kB	[list of files]
i386	56.0 kB	176.0 kB	[list of files]
mips64el	53.3 kB	187.0 kB	[list of files]
mipsel	52.9 kB	173.0 kB	[list of files]
ppc64el	56.4 kB	193.0 kB	[list of files]
s390x	52.9 kB	168.0 kB	[list of files]