Package: maffilter (1.3.1+dfsg-2 and others)

Links for maffilter

Debian Resources:

Download Source Package maffilter:

Maintainers:

Debian Med Packaging Team (QA Page, Mail Archive)
Andreas Tille (QA Page)
Julien Dutheil (QA Page)
Pranav Ballaney (QA Page)

External Resources:

Homepage [jydu.github.io]

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MafFilter applica una serie di "filtri" a un file MAF per ripulirlo, estrarre dati e calcolare statistiche tenendo traccia dei metadati associati come coordinate del genoma e punteggi di qualità.

 * Può elaborare l'allineamento per rimuovere regioni con bassa qualità /
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 * Può esportare i dati in un file di allineamenti multipli o singoli in
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 * Può leggere i dati delle annotazioni nel formato GFF o GTF ed estrarre
   l'allineamento corrispondente.
 * Può eseguire calcoli con finestre mobili.
 * Può ricostruire filogenie/genealogie insieme all'allineamento del
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dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

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dep: libstdc++6 (>= 5.2) [armel, armhf]

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sug: maffilter-examples

elabora allineamenti di genoma in Multiple Alignment Format (dati d'esempio)

Download maffilter

Download for all available architectures
Architecture	Version	Package Size	Installed Size	Files
amd64	1.3.1+dfsg-2+b1	255.5 kB	1,321.0 kB	[list of files]
arm64	1.3.1+dfsg-2+b1	235.9 kB	1,281.0 kB	[list of files]
armel	1.3.1+dfsg-2+b1	218.3 kB	1,148.0 kB	[list of files]
armhf	1.3.1+dfsg-2+b1	223.5 kB	1,020.0 kB	[list of files]
i386	1.3.1+dfsg-2+b1	262.6 kB	1,300.0 kB	[list of files]
mips64el	1.3.1+dfsg-2+b1	220.0 kB	1,456.0 kB	[list of files]
mipsel	1.3.1+dfsg-2+b1	222.4 kB	1,385.0 kB	[list of files]
ppc64el	1.3.1+dfsg-2+b1	254.2 kB	1,433.0 kB	[list of files]
s390x	1.3.1+dfsg-2+b1	234.7 kB	1,333.0 kB	[list of files]