Package: bandage (0.8.1-4)
Links for bandage
Debian Resources:
Download Source Package bandage:
Maintainers:
External Resources:
- Homepage [rrwick.github.io]
Similar packages:
applicazione bioinformatica per navigare facilmente grafi di assemblati de novo
Bandage è un programma con GUI che permette agli utenti di interagire con grafi di assemblati creati da assemblatori de novo come Velvet, SPAdes, MEGAHIT e altri.
I grafi degli assemblati de novo non contengono solo i contig assemblati, ma anche le connessioni tra tali contig, che precedentemente non erano facilmente accessibili. Bandage visualizza grafi di assemblati, con connessioni, usando algoritmi di disposizione di grafi. I nodi nel grafo disegnato, che rappresentano i contig, possono essere automaticamente etichettati con il loro ID, lunghezza o profondità. Gli utenti possono interagire con il grafo spostando, etichettando e colorando i nodi. Le informazioni sulla sequenza possono essere estratte anche direttamente dal visualizzatore del grafo. Visualizzando le connessioni tra contig, Bandage apre nuove possibilità per analizzare e migliorare gli assemblati de novo, che non sono possibili osservando i contig da soli.
Ulteriori informazioni e collegamenti per il download si trovano sul sito web di Bandage: rrwick.github.io/Bandage
Il pacchetto è attinente al campo dell'assemblaggio del genoma.
Other Packages Related to bandage
|
|
|
|
-
- dep: libc6 (>= 2.29)
- Libreria C GNU: librerie condivise
also a virtual package provided by libc6-udeb
-
- dep: libgcc-s1 (>= 4.0) [not arm64, mips64el]
- libreria di supporto a GCC
- dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [arm64, mips64el]
-
- dep: libqt5core5a (>= 5.14.1)
- modulo principale di Qt 5
-
- dep: libqt5gui5 (>= 5.8.0)
- modulo GUI di Qt 5
- or libqt5gui5-gles (>= 5.8.0)
- modulo GUI di Qt 5 — variante OpenGL ES
-
- dep: libqt5svg5 (>= 5.6.0~beta)
- modulo SVG di Qt 5
-
- dep: libqt5widgets5 (>= 5.11.0~rc1)
- modulo per widgets di Qt 5
-
- dep: libstdc++6 (>= 5.2)
- libreria GNU Standard C++, versione 3
Download bandage
| Architecture | Package Size | Installed Size | Files |
|---|---|---|---|
| amd64 | 918.9 kB | 2,140.0 kB | [list of files] |
| arm64 | 849.8 kB | 2,026.0 kB | [list of files] |
| armel | 841.1 kB | 1,957.0 kB | [list of files] |
| armhf | 844.1 kB | 1,569.0 kB | [list of files] |
| i386 | 953.4 kB | 2,168.0 kB | [list of files] |
| mips64el | 869.4 kB | 2,661.0 kB | [list of files] |
| mipsel | 873.8 kB | 2,569.0 kB | [list of files] |
| ppc64el | 914.5 kB | 2,527.0 kB | [list of files] |
| s390x | 855.3 kB | 2,195.0 kB | [list of files] |