Package: bandage (0.8.1-1)
Links for bandage
Debian Resources:
Download Source Package bandage:
Maintainers:
External Resources:
- Homepage [rrwick.github.io]
Similar packages:
applicazione bioinformatica per navigare facilmente grafi di assemblati de novo
Bandage è um programma con GUI che permette agli utenti di interagire con grafi di assemblati creati da assemblatori de novo come Velvet, SPAdes, MEGAHIT e altri.
I grafi degli assemblati de novo non contengono solo i contig assemblati, ma anche le connessioni tra tali contig, che precedentemente non erano facilmente accessibili. Bandage visualizza grafi di assemblati, con connessioni, usando algoritmi di disposizione di grafi. I nodi nel grafo disegnato, che rappresentano i contig, possono essere automaticamente etichettati con il loro ID, lunghezza o profondità. Gli utenti possono interagire con il grafo spostando, etichettando e colorando i nodi. Le informazioni sulla sequenza possono essere estratte anche direttamente dal visualizzatore del grafo. Visualizzando le connessioni tra contig, Bandage apre nuove possibilità per analizzare e migliorare gli assemblati de novo, che non sono possibili osservando i contig da soli.
Ulteriori informazioni e collegamenti per il download si trovano sul sito web di Bandage: rrwick.github.io/Bandage
Il pacchetto è attinente al campo dell'assemblaggio del genoma e sarà mantenuto dal gruppo Debian Med.
Other Packages Related to bandage
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- dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]
- Libreria C GNU: librerie condivise
also a virtual package provided by libc6-udeb
- dep: libc6 (>= 2.17) [arm64]
- dep: libc6 (>= 2.4) [armhf, i386]
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- dep: libgcc1 (>= 1:4.0) [not arm64]
- libreria di supporto a GCC
- dep: libgcc1 (>= 1:4.2) [arm64]
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- dep: libgl1 [not armhf]
- libreria di dispatch GL indipendente dal produttore -- vecchia gestione GL
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- dep: libgles2 [armhf]
- libreria di dispatch GL indipendente dal produttore -- gestione GLESv2
also a virtual package provided by mali-t62x-fbdev-driver, mali-t62x-wayland-driver, mali-t62x-x11-driver, mali-t76x-fbdev-driver, mali-t76x-wayland-driver, mali-t76x-x11-driver
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- dep: libqt5core5a (>= 5.11.0~rc1) [amd64, i386]
- modulo principale di Qt 5
- dep: libqt5core5a (>= 5.5.0) [arm64, armhf]
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- dep: libqt5gui5 (>= 5.8.0)
- modulo GUI di Qt 5
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- dep: libqt5svg5 (>= 5.6.0~beta)
- modulo SVG di Qt 5
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- dep: libqt5widgets5 (>= 5.11.0~rc1)
- modulo per widgets di Qt 5
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- dep: libstdc++6 (>= 5.2)
- libreria GNU Standard C++, versione 3
Download bandage
Architecture | Package Size | Installed Size | Files |
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amd64 | 925.1 kB | 2,236.0 kB | [list of files] |
arm64 | 860.8 kB | 2,134.0 kB | [list of files] |
armhf | 837.9 kB | 1,564.0 kB | [list of files] |
i386 | 972.7 kB | 2,320.0 kB | [list of files] |