Paquet : bandage (0.8.1-4)

Liens pour bandage

Ressources Debian :

Télécharger le paquet source bandage :

Responsables :

Ressources externes :

Page d'accueil [rrwick.github.io]

Paquets similaires :

application de bio-informatique pour navigation simple dans les graphes d’assemblage De novo

Bandage est un programme graphique permettant aux utilisateurs d’interagir avec les graphes d’assemblage réalisés par les assembleurs de novo tels que Velvet, SPAdes, MEGAHIT et d’autres.

Les graphes d’assemblage de novo contiennent non seulement les contigs assemblés, mais aussi les connexions entre ceux-ci, qui n’étaient auparavant pas faciles d’accès. Bandage visualise les graphes d’assemblage, avec les connexions, grâce à des algorithmes d’agencement de graphes. Les nœuds du graphe dessiné, qui représentent les contigs, peuvent être étiquetés automatiquement avec leur identifiant, leur longueur ou leur profondeur. Les utilisateurs peuvent interagir avec le graphe en déplaçant, étiquetant ou colorant les nœuds. L’information de séquence peut aussi être directement extraite du visionneur de graphe. En représentant les connexions entre contigs, Bandage ouvre de nouvelles possibilités d’analyse et d’amélioration des assemblages de novo qui n’étaient pas possibles en observant les contigs seuls.

Le site web de Bandage propose davantage d’informations et de liens de téléchargement : rrwick.github.io/Bandage.

Ce paquet est utile dans le domaine de l’assemblage de génome.

Étiquettes: Boîte à outils d'interface utilisateur: Qt

Autres paquets associés à bandage

dépendances

recommandations

suggestions

enhances

dep: libc6 (>= 2.29)

bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb
dep: libgcc-s1 (>= 4.0) [non arm64, mips64el]

bibliothèque de prise en charge de GCC

dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [arm64, mips64el]
dep: libqt5core5a (>= 5.14.1)

module principal de QT⋅5
dep: libqt5gui5 (>= 5.8.0)

module Qt⋅5 d'interface graphique

ou libqt5gui5-gles (>= 5.8.0)

Qt 5 GUI module — OpenGL ES variant
dep: libqt5svg5 (>= 5.6.0~beta)

module SVG de Qt⋅5
dep: libqt5widgets5 (>= 5.11.0~rc1)

module de widgets de Qt⋅5
dep: libstdc++6 (>= 5.2)

bibliothèque standard C++ de GNU v3

Télécharger bandage

Télécharger pour toutes les architectures proposées
Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
amd64	918,9 ko	2 140,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	849,8 ko	2 026,0 ko	[liste des fichiers]
armel	841,1 ko	1 957,0 ko	[liste des fichiers]
armhf	844,1 ko	1 569,0 ko	[liste des fichiers]
i386	953,4 ko	2 168,0 ko	[liste des fichiers]
mips64el	869,4 ko	2 661,0 ko	[liste des fichiers]
mipsel	873,8 ko	2 569,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64el	914,5 ko	2 527,0 ko	[liste des fichiers]
s390x	855,3 ko	2 195,0 ko	[liste des fichiers]