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identificazione della resistenza agli antibiotici tramite assemblati

ARIBA (Antibiotic Resistance Identification By Assembly) è uno strumento che identifica i geni della resistenza agli antibiotici eseguendo assemblati locali. L'input è un file FASTA di geni di riferimento e letture di sequenziamento accoppiate. ARIBA riferisce quali dei geni di riferimento sono stati trovati, più informazioni dettagliate sulla qualità degli assemblati e qualsiasi variante tra le letture di sequenziamento e i geni di riferimento.

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