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Package: apbs (3.4.1-5)

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risolutore adattivo di Poisson-Boltzmann

APBS è un pacchetto software per la risoluzione numerica delle equazioni di Poisson-Boltzmann (PBE), uno dei modelli continui più popolari per descrivere le interazioni elettrostatiche di soluti molecolari in soluzioni acquose salate. L'elettrostatica del continuo gioca un ruolo importante in molte aree di simulazione biomolecolare, incluse:

 * simulazione di processi di diffusione per determinare la cinetica
   del legame ligando-proteina o proteina-proteina;
 * dinamica molecolare del solvente implicito di biomolecole;
 * calcolo della solvatazione e dell'energia di legame per determinare le
   costanti di equilibrio del legame ligando-proteina e proteina-proteina
   e per facilitare la progettazione razionale di farmaci;
 * studi di titolazione biomolecolare.

APBS è stato progettato per valutare in modo efficiente le proprietà elettrostatiche in tali simulazioni per un'ampia gamma di larghezze di scala per permettere lo studio di molecole con decine e fino a milioni di atomi.

Questo pacchetto contiene il programma apbs e le utilità.

Tags: Field: Chemistry, Implemented in: C, User Interface: interface::commandline, role::program, Scope: Utility

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