Package: apbs (3.4.1-5)

Links for apbs

Debian Resources:

Download Source Package apbs:

Maintainers:

Debichem Team (QA Page, Mail Archive)
Michael Banck (QA Page)

External Resources:

Homepage [www.poissonboltzmann.org]

Similar packages:

Tilpasse Poisson-Boltzmann-problemløser

APBS er et en programpakke til numerisk problemløsning af Poisson- Boltzmann-ligningen, én af de mest populære kontinuum-modeller til beskrivelse af elektrostatisk interaktion mellem molekylære opløsninger i salte, vandholdige medier. Elektrostatisk kontinuum spiller en vigtig rolle i forskellige områder inden for biomolekylær simulering, inklusive:

 * simulering af diffusionsprocesser til fastlæggelse af kinetiske
   ligang-protein- og protein-protein-bindinger,
 * implicit opløsning af biomolekyler i molekylær dynamik,
 * energiberegninger i hydrater og bindinger til fastlæggelse af
   ligevægt mellem ligand-protein- og protein-protein-bindingskonstanter,
   og til at fremme rationelt design af medicin,
 * og studier i biomolekylær titrering.

APBS blev designet for effektiv evaluering af elektrostatiske egenskaber for sådanne simuleringer inden for bred række af længdeskalaer for at muliggøre undersøgelsen af molekyler med bestående af ti til millionvise af atomer.

Denne pakke indeholder programmet apbs og redskaber.

Tags: Field: Chemistry, Implemented in: C, User Interface: interface::commandline, role::program, Scope: Utility

Other Packages Related to apbs

depends

recommends

suggests

enhances

dep: apbs-data (= 3.4.1-5)

Datafiler for APBS (Adaptive Poisson Boltzmann Solver)
dep: libamd2 (>= 1:4.5.2)

Approximate minimum degree ordering-bibliotek for tynde matricer
dep: libapbs3 (= 3.4.1-5)

Adaptive Poisson Boltzmann Solver
dep: libarpack2 (>= 2.1)

Fortran77-underrutiner til at løse egenværdiproblemer i stor skala
dep: libblas3

Grundlæggende reference-implementeringer til lineær algebra, delt bibliotek

or libblas.so.3

virtual package provided by libatlas3-base, libblas3, libblis4-openmp, libblis4-pthread, libblis4-serial, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial
dep: libc6 (>= 2.34)

GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
also a virtual package provided by libc6-udeb
dep: libcamd2 (>= 1:4.5.2)

Symmetrisk omtrentligt minimumsbibliotek for tynde matricer
dep: libccolamd2 (>= 1:4.5.2)

constrained column approximate library for sparse matrices
dep: libcholmod3 (>= 1:4.5.2)

sparse Cholesky factorization library for sparse matrices
dep: libcolamd2 (>= 1:4.5.2)

Column approximate minimum degree ordering-bibliotek for tynde matricer
dep: libfetk1.9 (>= 3.4.1)

FETK libraries for APBS (shared libraries)
dep: libgomp1 (>= 4.2.1)

GCC OpenMP-understøttelsesbibliotek (GOMP)
dep: libjs-mathjax

JavaScript-visningsmotor for LaTeX og MathML
dep: libmaloc1 (>= 0.2-1)

Object-oriented Abstraction Layer for C
dep: libopenmpi3 (>= 4.1.4)

Bibliotek til beskedvideresendelse med høj ydelse - delt bibliotek
dep: libspqr2 (>= 1:5.12.0+dfsg)

Sparse QR factorization-bibliotek
dep: libstdc++6 (>= 4.1.1)

GNU Standard C++ bibliotek v3
dep: libsuitesparseconfig5 (>= 1:5.0.0)

Konfigurationsrutiner for alle SuiteSparse-moduler
dep: libsuperlu5 (>= 5.3.0+dfsg1)

Direkte løsning for store, sparse (tynde) systemer af lineære ligninger
dep: libumfpack5 (>= 1:4.5.2)

Sparse LU-faktoriseringsbibliotek

Download apbs

Download for all available architectures
Architecture	Package Size	Installed Size	Files
amd64	75.9 kB	364.0 kB	[list of files]
arm64	74.9 kB	1,252.0 kB	[list of files]
armel	76.3 kB	1,234.0 kB	[list of files]
armhf	73.2 kB	1,234.0 kB	[list of files]
i386	75.3 kB	358.0 kB	[list of files]
mips64el	76.6 kB	1,253.0 kB	[list of files]
mipsel	77.2 kB	1,236.0 kB	[list of files]
ppc64el	80.4 kB	1,252.0 kB	[list of files]
s390x	72.1 kB	311.0 kB	[list of files]