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Package: ampliconnoise (1.29-10 and others)

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rimozione di rumore da ampliconi PCR sequenziati con 454

AmpliconNoise è un pacchetto di applicazioni per ripulire dati di sequenziamento ad alte prestazioni. Consiste di tre parti principali:

 Pyronoise - esegue clustering basato su flowgram per individuare letture
 errate;
 SeqNoise - rimuove mutazioni puntuali PCR;
 Perseus - rimuove chimere PCR senza la necessità di un insieme di sequenze
 di riferimento.

Precedentemente esisteva un "Pyronoise" autonomo degli stessi autori e questo pacchetto include una versione aggiornata. C'è anche un "Denoiser" in Qiime che è collegato, ma distinto.

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armel 1.29-10+b2 1,068.5 kB2,388.0 kB [list of files]
armhf 1.29-10+b2 1,062.3 kB2,388.0 kB [list of files]
i386 1.29-10+b2 1,079.4 kB2,000.0 kB [list of files]
mips64el 1.29-10+b2 1,075.7 kB2,423.0 kB [list of files]
mipsel 1.29-10+b2 1,075.4 kB2,410.0 kB [list of files]
ppc64el 1.29-10+b2 1,097.9 kB3,105.0 kB [list of files]
s390x 1.29-10+b2 1,076.4 kB2,005.0 kB [list of files]