Пакунок: ampliconnoise (1.29-10 and others)

Links for ampliconnoise

Debian Resources:

Download Source Package ampliconnoise:

Maintainers:

Debian Med Packaging Team (QA Page, Mail Archive)
Tim Booth (QA Page)
Andreas Tille (QA Page)
Pranav Ballaney (QA Page)

External Resources:

Homepage [github.com]

Similar packages:

removal of noise from 454 sequenced PCR amplicons

AmpliconNoise is a package of applications to clean up high-throughput sequence data. It consists of three main parts:

Pyronoise - does flowgram-based clustering to spot misreads SeqNoise - removes PCR point mutations Perseus - removes PCR chimeras without the need for a set of reference sequences

Previously there was a standalone "Pyronoise" by the same authors and this package includes an updated version. There is also a "Denoiser" in Qiime which is related but distinct.

Tags: Role: Program

Інші пакунки пов'язані з ampliconnoise

depends

recommends

suggests

enhances

dep: libc6 (>= 2.34)

Бібліотека GNU C: спільні бібліотеки
also a virtual package provided by libc6-udeb
dep: libgsl27 (>= 2.7.1)

GNU Scientific Library (GSL) -- library package
dep: libopenmpi3 (>= 4.1.4)

high performance message passing library -- shared library
dep: mafft

Multiple alignment program for amino acid or nucleotide sequences

rec: openmpi-bin

high performance message passing library -- binaries

Завантажити ampliconnoise

Завантаження для всіх доступних архітектур
Архітектура	Версія	Розмір пакунка	Розмір після встановлення	Файли
amd64	1.29-10+b2	1,085.5 kB	2,041.0 kB	[список файлів]
arm64	1.29-10+b2	1,074.0 kB	2,401.0 kB	[список файлів]
armel	1.29-10+b2	1,068.5 kB	2,388.0 kB	[список файлів]
armhf	1.29-10+b2	1,062.3 kB	2,388.0 kB	[список файлів]
i386	1.29-10+b2	1,079.4 kB	2,000.0 kB	[список файлів]
mips64el	1.29-10+b2	1,075.7 kB	2,423.0 kB	[список файлів]
mipsel	1.29-10+b2	1,075.4 kB	2,410.0 kB	[список файлів]
ppc64el	1.29-10+b2	1,097.9 kB	3,105.0 kB	[список файлів]
s390x	1.29-10+b2	1,076.4 kB	2,005.0 kB	[список файлів]