[ Paquet source : unicycler ]
Paquet : unicycler (0.4.7+dfsg-2)
Liens pour unicycler
Ressources Debian :
- Rapports de bogues
- Developer Information
- Journal des modifications Debian
- Fichier de licence
- Suivis des correctifs pour Debian
Télécharger le paquet source unicycler :
- [unicycler_0.4.7+dfsg-2.dsc]
- [unicycler_0.4.7+dfsg.orig.tar.xz]
- [unicycler_0.4.7+dfsg-2.debian.tar.xz]
Responsables :
- Debian Med Packaging Team (Page QA, Archive du courrier électronique)
- Andreas Tille (Page QA)
- Liubov Chuprikova (Page QA)
Ressources externes :
- Page d'accueil [github.com]
Paquets similaires :
hybrid assembly pipeline for bacterial genomes
Unicycler is an assembly pipeline for bacterial genomes. It can assemble Illumina-only read sets where it functions as a SPAdes-optimiser. It can also assembly long-read-only sets (PacBio or Nanopore) where it runs a miniasm+Racon pipeline. For the best possible assemblies, give it both Illumina reads and long reads, and it will conduct a hybrid assembly.
Autres paquets associés à unicycler
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- dep: bowtie2
- aligneur ultra-rapide de lectures courtes avec une faible empreinte mémoire
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- dep: default-jre
- environnement d'exécution Java standard ou compatible
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- dep: libc6 (>= 2.14)
- bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb
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- dep: libgcc1 (>= 1:3.0)
- bibliothèque de prise en charge de GCC
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- dep: libstdc++6 (>= 6)
- bibliothèque standard C++ de GNU v3
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- dep: ncbi-blast+
- suite d'outils de recherche de séquences BLAST de dernière génération
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- dep: pilon
- automated genome assembly improvement and variant detection tool
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- dep: python3
- langage orienté objet interactif de haut niveau – version par défaut de Python 3
- dep: python3 (>= 3~)
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- dep: python3-setuptools
- Améliorations de Python3 Distutils
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- dep: racon
- consensus module for raw de novo DNA assembly of long uncorrected reads
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- dep: samtools
- traitement d'alignements de séquence pour les formats SAM et BAM et CRAM
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- dep: spades
- assembleur génomique pour des ensembles de données de « single-cell » et « isolates »
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- dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
- Bibliothèque de compression - binaires
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- rec: unicycler-data
- hybrid assembly pipeline for bacterial genomes (data package)
Télécharger unicycler
| Architecture | Taille du paquet | Espace occupé une fois installé | Fichiers |
|---|---|---|---|
| amd64 | 852,3 ko | 3 429,0 ko | [liste des fichiers] |