Paquet : bali-phy (3.4+dfsg-1)
Liens pour bali-phy
Ressources Debian :
- Rapports de bogues
- Developer Information
- Journal des modifications Debian
- Fichier de licence
- Suivis des correctifs pour Debian
Télécharger le paquet source bali-phy :
Responsables :
Ressources externes :
- Page d'accueil [www.bali-phy.org]
Paquets similaires :
inférence bayésienne d’alignement et de phylogénie
BAli-Phy évalue plusieurs alignements de séquence et d’arbres évolutionnaires à partir d’ADN non aligné, d’acide aminé ou de séquences de codons. BAli-Phy utilise MCMC pour évaluer les arbres évolutionnaires, la sélection positive et les longueurs de branches tout en moyennant d’autres alignements possibles. BAli-Phy peut afficher graphiquement l’ambiguïté d’alignement dans un graphe d’incertitude d’alignement (AU).
BAli-Phy peut également évaluer les phylogénies à partir d’un alignement fixé (comme MrBayes et BEAST) grâce à des modèles de substitution tels que GTR+gamma. BAli-Phy évalue automatiquement les taux relatifs de chaque gène.
Autres paquets associés à bali-phy
|
|
|
|
-
- dep: libboost-chrono1.67.0
- représentation⋅C++ d'intervalle de temps, de point temporel et d'horloges
-
- dep: libboost-filesystem1.67.0
- opérations sur le système de fichiers (chemins portables, itération sur des répertoires,⋅etc.) en C++
-
- dep: libboost-program-options1.67.0
- bibliothèque d'options de programmes pour C++
-
- dep: libboost-random1.67.0
- bibliothèque Boost de nombres aléatoires
-
- dep: libboost-system1.67.0
- bibliothèque de système d'exploitation (par ex. gestion des diagnostics)
-
- dep: libc6 (>= 2.23)
- bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb
-
- dep: libcairo2 (>= 1.4.10)
- Bibliothèque graphique vectorielle Cairo 2D
-
- dep: libgcc1 (>= 1:3.4) [amd64]
- bibliothèque de prise en charge de GCC
- dep: libgcc1 (>= 1:3.5) [armhf]
- dep: libgcc1 (>= 1:4.2) [arm64, i386]
-
- dep: libstdc++6 (>= 5.2)
- bibliothèque standard C++ de GNU v3
-
- dep: perl
- langage de rapports et d'extractions pratiques de Larry Wall
-
- rec: gnuplot
- programme de tracé interactif en ligne de commande
un paquet virtuel est également fourni par gnuplot-nox, gnuplot-qt, gnuplot-x11
-
- rec: r-base
- système de calcul statistique et de graphique GNU R
Télécharger bali-phy
Architecture | Taille du paquet | Espace occupé une fois installé | Fichiers |
---|---|---|---|
amd64 | 5 017,5 ko | 25 561,0 ko | [liste des fichiers] |
arm64 | 4 682,4 ko | 23 393,0 ko | [liste des fichiers] |
armhf | 3 939,7 ko | 15 849,0 ko | [liste des fichiers] |
i386 | 4 913,3 ko | 25 392,0 ko | [liste des fichiers] |