Paquet : samtools (1.16.1-1)
Liens pour samtools
Ressources Debian :
- Rapports de bogues
- Developer Information
- Journal des modifications Debian
- Fichier de licence
- Suivis des correctifs pour Debian
Télécharger le paquet source samtools :
Responsables :
- Debian Med Packaging Team (Page QA, Archive du courrier électronique)
- Charles Plessy (Page QA)
- Andreas Tille (Page QA)
- Étienne Mollier (Page QA)
Ressources externes :
- Page d'accueil [www.htslib.org]
Paquets similaires :
traitement d'alignements de séquence pour les formats SAM et BAM et CRAM
Samtools est un ensemble d'utilitaires qui manipulent les alignements de séquence de nucléotides dans le format binaire BAM. Il est capable d'importer et d'exporter à partir des formats ASCII SAM (Sequence Alignment/Map) et CRAM, de trier, de fusionner, d'indexer et de récupérer des enregistrements dans n'importe quelle région facilement. Il est conçu pour travailler sur un flux de données et est capable d'ouvrir un fichier BAM ou CRAM (mais pas SAM) sur un serveur HTTP ou FTP distant.
Autres paquets associés à samtools
|
|
|
|
-
- dep: libc6 (>= 2.34)
- bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb
-
- dep: libhts3 (>= 1.16)
- C library for high-throughput sequencing data formats
-
- dep: libncurses6 (>= 6)
- Bibliothèques partagées pour l'utilisation d'un terminal
-
- dep: libtinfo6 (>= 6)
- bibliothèque partagée terminfo de bas niveau pour manipuler le terminal
-
- dep: zlib1g (>= 1:1.1.4) [non armel, armhf, i386, mipsel]
- Bibliothèque de compression - binaires
- dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3) [armel, armhf, i386, mipsel]
-
- sug: cwltool
- implémentation de la référence du langage Common Workflow
Télécharger samtools
Architecture | Taille du paquet | Espace occupé une fois installé | Fichiers |
---|---|---|---|
amd64 | 592,4 ko | 1 304,0 ko | [liste des fichiers] |
arm64 | 566,4 ko | 1 580,0 ko | [liste des fichiers] |
armel | 558,8 ko | 1 573,0 ko | [liste des fichiers] |
armhf | 561,4 ko | 1 445,0 ko | [liste des fichiers] |
i386 | 622,1 ko | 1 417,0 ko | [liste des fichiers] |
mips64el | 572,9 ko | 1 729,0 ko | [liste des fichiers] |
mipsel | 581,2 ko | 1 659,0 ko | [liste des fichiers] |
ppc64el | 614,7 ko | 1 836,0 ko | [liste des fichiers] |
s390x | 566,6 ko | 1 332,0 ko | [liste des fichiers] |