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Paquet : samtools (1.16.1-1)

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traitement d'alignements de séquence pour les formats SAM et BAM et CRAM

Samtools est un ensemble d'utilitaires qui manipulent les alignements de séquence de nucléotides dans le format binaire BAM. Il est capable d'importer et d'exporter à partir des formats ASCII SAM (Sequence Alignment/Map) et CRAM, de trier, de fusionner, d'indexer et de récupérer des enregistrements dans n'importe quelle région facilement. Il est conçu pour travailler sur un flux de données et est capable d'ouvrir un fichier BAM ou CRAM (mais pas SAM) sur un serveur HTTP ou FTP distant.

Étiquettes: Domaine: Biologie, Bio-informatique, Mis en œuvre en: implemented-in::c, interface::commandline, Réseau: Client, Protocole réseau: FTP, protocol::http, role::program, Champ d'application: Utilitaire, Boîte à outils d'interface utilisateur: Interface utilisateur texte ncurses, But: use::analysing, use::calculating, Filtrage, Fonctionne avec: Séquence biologique

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armhf 561,4 ko1 445,0 ko [liste des fichiers]
i386 622,1 ko1 417,0 ko [liste des fichiers]
mips64el 572,9 ko1 729,0 ko [liste des fichiers]
mipsel 581,2 ko1 659,0 ko [liste des fichiers]
ppc64el 614,7 ko1 836,0 ko [liste des fichiers]
s390x 566,6 ko1 332,0 ko [liste des fichiers]