Balík: samtools (1.16.1-1)

Odkazy pre samtools

Zdroje Debian:

Stiahnuť zdrojový balík samtools:

Správcovia:

Externé zdroje:

Domovská stránka [www.htslib.org]

Podobné balíky:

processing sequence alignments in SAM, BAM and CRAM formats

Samtools is a set of utilities that manipulate nucleotide sequence alignments in the binary BAM format. It imports from and exports to the ascii SAM (Sequence Alignment/Map) and CRAM formats, does sorting, merging and indexing, and allows one to retrieve reads in any regions swiftly. It is designed to work on a stream, and is able to open a BAM or CRAM (not SAM) file on a remote FTP or HTTP server.

Značky: Pole: Biológia, Bioinformatika, Implementované v: implemented-in::c, interface::commandline, Networking: Klient, Network Protocol: FTP, protocol::http, role::program, Scope: Utility, Sada nástrojov používateľského rozhrania: Ncurses TUI, Purpose: use::analysing, use::calculating, Filtrovanie, Works with: Biologické sekvencie

Ostatné balíky súvisiace s balíkom samtools

závisí

odporúča

navrhuje

vylepšuje

dep: libc6 (>= 2.34)

knižnica GNU C - zdieľané knižnice
tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6-udeb
dep: libhts3 (>= 1.16)

C library for high-throughput sequencing data formats
dep: libncurses6 (>= 6)

zdieľané knižnice na obsluhu terminálu
dep: libtinfo6 (>= 6)

zdieľaná nízkoúrovňová knižnica terminfo na obsluhu terminálu
dep: zlib1g (>= 1:1.1.4) [nie armel, armhf, i386, mipsel]

komprimačná knižnica - dynamická verzia

dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3) [armel, armhf, i386, mipsel]

sug: cwltool

Common Workflow Language reference implementation

Stiahnuť samtools

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry
Architektúra	Veľkosť balíka	Nainštalovaná veľkosť	Súbory
amd64	592.4 kB	1,304.0 kB	[zoznam súborov]
arm64	566.4 kB	1,580.0 kB	[zoznam súborov]
armel	558.8 kB	1,573.0 kB	[zoznam súborov]
armhf	561.4 kB	1,445.0 kB	[zoznam súborov]
i386	622.1 kB	1,417.0 kB	[zoznam súborov]
mips64el	572.9 kB	1,729.0 kB	[zoznam súborov]
mipsel	581.2 kB	1,659.0 kB	[zoznam súborov]
ppc64el	614.7 kB	1,836.0 kB	[zoznam súborov]
s390x	566.6 kB	1,332.0 kB	[zoznam súborov]