Package: libseqlib2 (1.2.0+dfsg-11 and others)
Links for libseqlib2
Debian Resources:
Download Source Package libseqlib:
- [libseqlib_1.2.0+dfsg-11.dsc]
- [libseqlib_1.2.0+dfsg.orig.tar.xz]
- [libseqlib_1.2.0+dfsg-11.debian.tar.xz]
Maintainers:
External Resources:
- Homepage [github.com]
Similar packages:
C++ htslib/bwa-mem/fermi-grænseflade for interrogating sequence-data
C++-API og kommandolinjeværktøj der tilbyder en hurtig og brugervenlig grænseflade til BAM/SAM/CRAM-filer, globale sekvenssammenligningsoperationer og sekvenssamling. Fire C-biblioteker udfører de grundlæggende operationer i SeqLib: HTSlib for BAM-adgang, BWA-MEM og BLAT for sekvenssammenligning og Fermi for fejlrettelse og sekvenssamling. Sammenligninger indikerer at SeqLib har lavere cpu- og hukommelseskrav end førende C++-sekvensanalyse-API'er. Minimal SeqLib-kode kan udtrække, rette fejl og samle læsninger fra en CRAM-fil og så sammenligne med BWA-MEM. SeqLib tilyder også yderligere funktioner, inklusive kromosom-egnede intervalforespørgsler og plot med læsninger. Kommandolinjeværktøjer er tilgængelige for udførelse af integreret fejlrettelse, mikrosamlinger og sammenligning.
Other Packages Related to libseqlib2
|
|
|
|
-
- dep: libbz2-1.0 [sparc64]
- højkvalitets bloksorteringsfilpakningsbibliotek - kørselstid
-
- dep: libc6 (>= 2.33) [not alpha, armel, armhf, ia64, m68k, sh4]
- GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
also a virtual package provided by libc6-udeb
- dep: libc6 (>= 2.34) [armel, armhf, m68k]
- dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]
-
- dep: libc6.1 (>= 2.33) [alpha]
- GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
also a virtual package provided by libc6.1-udeb
- dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]
-
- dep: libfml0 (>= 0.1+git20190320.b499514)
- Bibliotek til at samle Illumina-korte læsninger i små regioner
-
- dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, i386, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, x32]
- GCC støttebibliotek
- dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64, sparc64]
- dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]
- dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64, sh4]
-
- dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]
- GCC støttebibliotek
-
- dep: libhts3t64 (>= 1.17)
- C-bibliotek for høj-gennemløb sekvensdataformater
-
- dep: libjsoncpp25 (>= 1.9.5)
- Bibliotek til at læse og skrive JSON for C++
-
- dep: liblzma5 (>= 5.1.1alpha+20110809) [sparc64]
- Kompressionsbibliotek for XZ-formatet
-
- dep: libssw0 (>= 1.1)
- fast SIMD parallelized implementation of the Smith-Waterman algorithm
-
- dep: libstdc++6 (>= 13.1)
- GNU Standard C++ bibliotek v3
-
- dep: libunwind8 [ia64]
- Bibliotek til at bestemme call-chain for et program - kørselstid
-
- dep: zlib1g (>= 1:1.1.4) [not armel, armhf, m68k, sh4]
- Komprimeringsbibliotek - kørselstid
- dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3) [armel, armhf, m68k, sh4]
Download libseqlib2
| Architecture | Version | Package Size | Installed Size | Files |
|---|---|---|---|---|
| alpha (unofficial port) | 1.2.0+dfsg-11+b1 | 148.5 kB | 538.0 kB | [list of files] |
| amd64 | 1.2.0+dfsg-11+b1 | 167.7 kB | 569.0 kB | [list of files] |
| arm64 | 1.2.0+dfsg-11+b1 | 140.9 kB | 468.0 kB | [list of files] |
| armel | 1.2.0+dfsg-11+b1 | 132.9 kB | 431.0 kB | [list of files] |
| armhf | 1.2.0+dfsg-11+b1 | 135.8 kB | 335.0 kB | [list of files] |
| i386 | 1.2.0+dfsg-11+b1 | 174.9 kB | 511.0 kB | [list of files] |
| ia64 (unofficial port) | 1.2.0+dfsg-11+b1 | 192.3 kB | 885.0 kB | [list of files] |
| m68k (unofficial port) | 1.2.0+dfsg-11+b1 | 152.1 kB | 475.0 kB | [list of files] |
| mips64el | 1.2.0+dfsg-11+b1 | 140.6 kB | 558.0 kB | [list of files] |
| ppc64 (unofficial port) | 1.2.0+dfsg-11+b1 | 164.4 kB | 661.0 kB | [list of files] |
| ppc64el | 1.2.0+dfsg-11+b1 | 165.1 kB | 597.0 kB | [list of files] |
| riscv64 | 1.2.0+dfsg-11+b1 | 155.1 kB | 404.0 kB | [list of files] |
| s390x | 1.2.0+dfsg-11+b1 | 154.8 kB | 512.0 kB | [list of files] |
| sh4 (unofficial port) | 1.2.0+dfsg-11+b1 | 177.9 kB | 470.0 kB | [list of files] |
| sparc64 (unofficial port) | 1.2.0+dfsg-11+b1 | 129.8 kB | 1,061.0 kB | [list of files] |
| x32 (unofficial port) | 1.2.0+dfsg-11+b1 | 162.8 kB | 471.0 kB | [list of files] |