Package: libseqlib2 (1.2.0+dfsg-9)
Links for libseqlib2
Debian Resources:
Download Source Package libseqlib:
- [libseqlib_1.2.0+dfsg-9.dsc]
- [libseqlib_1.2.0+dfsg.orig.tar.xz]
- [libseqlib_1.2.0+dfsg-9.debian.tar.xz]
Maintainers:
External Resources:
- Homepage [github.com]
Similar packages:
C++ htslib/bwa-mem/fermi-grænseflade for interrogating sequence-data
C++-API og kommandolinjeværktøj der tilbyder en hurtig og brugervenlig grænseflade til BAM/SAM/CRAM-filer, globale sekvenssammenligningsoperationer og sekvenssamling. Fire C-biblioteker udfører de grundlæggende operationer i SeqLib: HTSlib for BAM-adgang, BWA-MEM og BLAT for sekvenssammenligning og Fermi for fejlrettelse og sekvenssamling. Sammenligninger indikerer at SeqLib har lavere cpu- og hukommelseskrav end førende C++-sekvensanalyse-API'er. Minimal SeqLib-kode kan udtrække, rette fejl og samle læsninger fra en CRAM-fil og så sammenligne med BWA-MEM. SeqLib tilyder også yderligere funktioner, inklusive kromosom-egnede intervalforespørgsler og plot med læsninger. Kommandolinjeværktøjer er tilgængelige for udførelse af integreret fejlrettelse, mikrosamlinger og sammenligning.
Other Packages Related to libseqlib2
|
|
|
|
-
- dep: libc6 (>= 2.33)
- GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
also a virtual package provided by libc6-udeb
-
- dep: libfml0 (>= 0.1+git20190320.b499514)
- Bibliotek til at samle Illumina-korte læsninger i små regioner
-
- dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [not armel, armhf, mipsel]
- GCC støttebibliotek
- dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]
- dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [mipsel]
-
- dep: libhts3 (>= 1.10)
- C-bibliotek for høj-gennemløb sekvensdataformater
-
- dep: libjsoncpp25 (>= 1.9.5)
- Bibliotek til at læse og skrive JSON for C++
-
- dep: libssw0 (>= 1.1)
- fast SIMD parallelized implementation of the Smith-Waterman algorithm
-
- dep: libstdc++6 (>= 11)
- GNU Standard C++ bibliotek v3
-
- dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
- Komprimeringsbibliotek - kørselstid
Download libseqlib2
| Architecture | Package Size | Installed Size | Files |
|---|---|---|---|
| amd64 | 158.0 kB | 553.0 kB | [list of files] |
| arm64 | 137.6 kB | 468.0 kB | [list of files] |
| armel | 127.8 kB | 467.0 kB | [list of files] |
| armhf | 132.5 kB | 339.0 kB | [list of files] |
| i386 | 165.4 kB | 499.0 kB | [list of files] |
| mips64el | 138.7 kB | 557.0 kB | [list of files] |
| mipsel | 139.6 kB | 551.0 kB | [list of files] |
| ppc64el | 162.4 kB | 597.0 kB | [list of files] |
| s390x | 135.7 kB | 496.0 kB | [list of files] |