[ Source: e-mem ]
Package: e-mem (1.0.1-5 and others)
Links for e-mem
Debian Resources:
Download Source Package e-mem:
Maintainers:
External Resources:
- Homepage [www.csd.uwo.ca]
Similar packages:
Effektiv beregning af Maximal Exact Matches for meget store genomer
E-MEM aktiverer effektiv beregning af Macimal Exact Matches (MEM'er), som ikke bruger fuld tekst-indeks. Algoritmen bruger meget mindre plads og er meget modtagelig for parallelisering. Den kan beregne alle MEM'er med minimumslængden 100 mellem hele menneske- og musegenomet på en 12-kerne maskine på 10 min. og med 2 GB hukommelse; den krævede hukommelse kan være så lav som 600 MB. Kan effektivt behandle genomer i alle størrelser. Omfattende test og sammenligning med de i øjeblikket bedste algoritmer er indeholdt.
Mummer har mange forskellige skripter, hvor et af nøgleprogrammerne er MEM- beregning. I alle skripterne, kan MEM-beregningsprogrammet nemt erstattes med e-mem for bedre ydelse.
Other Packages Related to e-mem
|
|
|
|
-
- dep: libc6 (>= 2.11) [hppa]
- GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
also a virtual package provided by libc6-udeb
- dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]
- dep: libc6 (>= 2.16) [x32]
- dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]
- dep: libc6 (>= 2.31) [sh4]
- dep: libc6 (>= 2.34) [riscv64]
- dep: libc6 (>= 2.4) [armel, armhf, i386, m68k, mips64el, ppc64, s390x, sparc64]
-
- dep: libc6.1 (>= 2.31) [ia64]
- GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
also a virtual package provided by libc6.1-udeb
- dep: libc6.1 (>= 2.4) [alpha]
-
- dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, x32]
- GCC støttebibliotek
- dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64, sparc64]
- dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]
- dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386, ia64, sh4]
-
- dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]
- GCC støttebibliotek
-
- dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]
- GCC støttebibliotek
-
- dep: libgomp1 (>= 4.9)
- GCC OpenMP-understøttelsesbibliotek (GOMP)
-
- dep: libstdc++6 (>= 13.1) [riscv64]
- GNU Standard C++ bibliotek v3
- dep: libstdc++6 (>= 5.2) [not riscv64]
-
- dep: libunwind8 [ia64]
- Bibliotek til at bestemme call-chain for et program - kørselstid
-
- enh: mummer
- Effektiv sekvensjustering for hele genomer
Download e-mem
| Architecture | Version | Package Size | Installed Size | Files |
|---|---|---|---|---|
| alpha (unofficial port) | 1.0.1-5 | 33.7 kB | 106.0 kB | [list of files] |
| amd64 | 1.0.1-5 | 34.0 kB | 106.0 kB | [list of files] |
| arm64 | 1.0.1-5 | 31.0 kB | 94.0 kB | [list of files] |
| armel | 1.0.1-5 | 33.9 kB | 101.0 kB | [list of files] |
| armhf | 1.0.1-5 | 33.6 kB | 81.0 kB | [list of files] |
| hppa (unofficial port) | 1.0.1-5 | 39.3 kB | 106.0 kB | [list of files] |
| i386 | 1.0.1-5 | 40.2 kB | 117.0 kB | [list of files] |
| ia64 (unofficial port) | 1.0.1-5 | 43.8 kB | 162.0 kB | [list of files] |
| m68k (unofficial port) | 1.0.1-5 | 37.8 kB | 113.0 kB | [list of files] |
| mips64el | 1.0.1-5 | 33.7 kB | 117.0 kB | [list of files] |
| ppc64 (unofficial port) | 1.0.1-5 | 34.8 kB | 162.0 kB | [list of files] |
| ppc64el | 1.0.1-5 | 34.5 kB | 162.0 kB | [list of files] |
| riscv64 | 1.0.1-5+b1 | 33.6 kB | 87.0 kB | [list of files] |
| s390x | 1.0.1-5 | 31.5 kB | 102.0 kB | [list of files] |
| sh4 (unofficial port) | 1.0.1-5 | 46.7 kB | 105.0 kB | [list of files] |
| sparc64 (unofficial port) | 1.0.1-5 | 30.4 kB | 100.0 kB | [list of files] |
| x32 (unofficial port) | 1.0.1-5 | 34.4 kB | 101.0 kB | [list of files] |