[ Источник: e-mem ]
Пакет: e-mem (1.0.1-5 и другие)
Ссылки для e-mem
Ресурсы Debian:
- Сообщения об ошибках
- Developer Information
- Debian журнал изменений
- Файл авторских прав
- Отслеживание заплат Debian
Исходный код e-mem:
Сопровождающие:
- Debian Med Packaging Team (Страница КК, Почтовый архив)
- Andreas Tille (Страница КК)
- Étienne Mollier (Страница КК)
Внешние ресурсы:
- Сайт [www.csd.uwo.ca]
Подобные пакеты:
Efficient computation of Maximal Exact Matches for very large genomes
E-MEM enables efficient computation of Maximal Exact Matches (MEMs) that does not use full text indexes. The algorithm uses much less space and is highly amenable to parallelization. It can compute all MEMs of minimum length 100 between the whole human and mouse genomes on a 12 core machine in 10 min and 2 GB of memory; the required memory can be as low as 600 MB. It can run efficiently genomes of any size. Extensive testing and comparison with currently best algorithms is provided.
Mummer has many different scripts where one of the key program is MEM computation. In all the scripts, the MEM computation program can be replaced with e-mem with ease for better performance.
Другие пакеты, относящиеся к e-mem
|
|
|
|
-
- dep: libc6 (>= 2.11) [hppa]
- библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb
- dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]
- dep: libc6 (>= 2.16) [x32]
- dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]
- dep: libc6 (>= 2.31) [sh4]
- dep: libc6 (>= 2.34) [riscv64]
- dep: libc6 (>= 2.4) [armel, armhf, i386, m68k, mips64el, ppc64, s390x, sparc64]
-
- dep: libc6.1 (>= 2.31) [ia64]
- библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
также виртуальный пакет, предоставляемый libc6.1-udeb
- dep: libc6.1 (>= 2.4) [alpha]
-
- dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, x32]
- вспомогательная библиотека GCC
- dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64, sparc64]
- dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]
- dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386, ia64, sh4]
-
- dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]
- вспомогательная библиотека GCC
-
- dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]
- вспомогательная библиотека GCC
-
- dep: libgomp1 (>= 4.9)
- вспомогательная библиотека GCC OpenMP (GOMP)
-
- dep: libstdc++6 (>= 13.1) [riscv64]
- стандартная библиотека GNU C++ версии 3
- dep: libstdc++6 (>= 5.2) [не riscv64]
-
- dep: libunwind8 [ia64]
- library to determine the call-chain of a program - runtime
-
- enh: mummer
- Efficient sequence alignment of full genomes
Загрузка e-mem
| Архитектура | Версия | Размер пакета | В установленном виде | Файлы |
|---|---|---|---|---|
| alpha (неофициальный перенос) | 1.0.1-5 | 33,7 Кб | 106,0 Кб | [список файлов] |
| amd64 | 1.0.1-5 | 34,0 Кб | 106,0 Кб | [список файлов] |
| arm64 | 1.0.1-5 | 31,0 Кб | 94,0 Кб | [список файлов] |
| armel | 1.0.1-5 | 33,9 Кб | 101,0 Кб | [список файлов] |
| armhf | 1.0.1-5 | 33,6 Кб | 81,0 Кб | [список файлов] |
| hppa (неофициальный перенос) | 1.0.1-5 | 39,3 Кб | 106,0 Кб | [список файлов] |
| i386 | 1.0.1-5 | 40,2 Кб | 117,0 Кб | [список файлов] |
| ia64 (неофициальный перенос) | 1.0.1-5 | 43,8 Кб | 162,0 Кб | [список файлов] |
| m68k (неофициальный перенос) | 1.0.1-5 | 37,8 Кб | 113,0 Кб | [список файлов] |
| mips64el | 1.0.1-5 | 33,7 Кб | 117,0 Кб | [список файлов] |
| ppc64 (неофициальный перенос) | 1.0.1-5 | 34,8 Кб | 162,0 Кб | [список файлов] |
| ppc64el | 1.0.1-5 | 34,5 Кб | 162,0 Кб | [список файлов] |
| riscv64 | 1.0.1-5+b1 | 33,6 Кб | 87,0 Кб | [список файлов] |
| s390x | 1.0.1-5 | 31,5 Кб | 102,0 Кб | [список файлов] |
| sh4 (неофициальный перенос) | 1.0.1-5 | 46,7 Кб | 105,0 Кб | [список файлов] |
| sparc64 (неофициальный перенос) | 1.0.1-5 | 30,4 Кб | 100,0 Кб | [список файлов] |
| x32 (неофициальный перенос) | 1.0.1-5 | 34,4 Кб | 101,0 Кб | [список файлов] |