all options
bullseye  ] [  bookworm  ] [  trixie  ] [  sid  ]
[ Source: quicktree  ]

Package: quicktree (2.5-5)

Links for quicktree

Screenshot

Debian Resources:

Download Source Package quicktree:

Maintainers:

External Resources:

Similar packages:

Neighbor-Joining-algoritme for fylogenier

Quicktree er en effektiv implementering af Neighbor-Joining-algoritmen (PMID: 3447015), der kan rekonstruere fylogenier fra store sammenligninger i tid mindre end universets alder.

QuickTree accepterer både afstandsmatrix og data fra multiple-sequence-alignment. Den første skal være i PHYLIP-format. Den sidste skal være i Stockholm-format, der er standardformet for sammenligning for Pfam-databasen. Sammenligninger i forskellige formater kan konverteres til Stockholm-formatet via programmet sreformat, der er en del af pakken HMMer (hmmer.org).

Tress skrives til standardud, i Newick/New-Hampshire-formatet brugt af PHYLIP og mange andre programmer.

Other Packages Related to quicktree

  • depends
  • recommends
  • suggests
  • enhances

Download quicktree

Download for all available architectures
Architecture Package Size Installed Size Files
amd64 20.5 kB56.0 kB [list of files]
arm64 19.2 kB56.0 kB [list of files]
armel 19.8 kB56.0 kB [list of files]
armhf 17.5 kB44.0 kB [list of files]
i386 21.3 kB60.0 kB [list of files]
mips64el 21.1 kB64.0 kB [list of files]
mipsel 20.9 kB62.0 kB [list of files]
ppc64el 23.3 kB85.0 kB [list of files]
s390x 19.7 kB60.0 kB [list of files]