[ Source: libfastahack ]
Package: fastahack (1.0.0+dfsg-7)
Links for fastahack
Debian Resources:
Download Source Package libfastahack:
- [libfastahack_1.0.0+dfsg-7.dsc]
- [libfastahack_1.0.0+dfsg.orig.tar.xz]
- [libfastahack_1.0.0+dfsg-7.debian.tar.xz]
Maintainers:
External Resources:
- Homepage [github.com]
Similar packages:
Redskab for indeksering og sekvensudtrækning fra FASTA-filer
Fastahack er et lille program til indeksering og udtrækning af sekvenser og undersekvenser fra FASTA-filer. Det inkluderede Fasta.cpp-bibliotek tilbyder en FASTA-læser og et indeksprogram, som kan indlejres i programmer, som vil have nytte af direkte læsning af undersekvenser fra FASTA-filer. Biblioteket håndterer automatisk oprettelse af indeksfil og brug.
Funktioner:
* FASTA-indeksoprettelse (.fai) for FASTA-filer * Sekvensudtrækning * Undersekvensudtrækning * Sekvensstatistik (i øjeblikket er kun entropi indeholdt)
Sekvens- og undersekvensudtrækning bruger fseek64 til at tilbyde hurtigst mulig udtrækning uden RAM-intensive operationer for filindlæsning. Dette gør fastahack til et nyttigt værktøj for bioinformatikere, som hurtigt skal udtrække mange undersekvenser fra en FASTA-referencesekvens.
Other Packages Related to fastahack
|
|
|
|
-
- dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]
- GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
also a virtual package provided by libc6-udeb
- dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]
- dep: libc6 (>= 2.4) [not amd64, arm64, ppc64el]
-
- dep: libdisorder0 (>= 0.0.2)
- Bibliotek for entropimåling af bytestrømme
-
- dep: libfastahack0 (>= 0.0+git20160702.bbc645f) [amd64, arm64, mips64el, ppc64el]
- Bibliotek for indeksering og sekvensudtrækning fra FASTA-filer - bibliotek
- dep: libfastahack0 (>= 1.0.0+dfsg) [not amd64, arm64, mips64el, ppc64el]
-
- dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [not armel, armhf]
- GCC støttebibliotek
- dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]
-
- dep: libstdc++6 (>= 5.2)
- GNU Standard C++ bibliotek v3
Download fastahack
| Architecture | Package Size | Installed Size | Files |
|---|---|---|---|
| amd64 | 12.1 kB | 40.0 kB | [list of files] |
| arm64 | 11.5 kB | 40.0 kB | [list of files] |
| armel | 11.5 kB | 35.0 kB | [list of files] |
| armhf | 11.5 kB | 35.0 kB | [list of files] |
| i386 | 12.5 kB | 43.0 kB | [list of files] |
| mips64el | 11.8 kB | 41.0 kB | [list of files] |
| mipsel | 11.8 kB | 40.0 kB | [list of files] |
| ppc64el | 12.1 kB | 84.0 kB | [list of files] |
| s390x | 11.7 kB | 40.0 kB | [list of files] |