Package: gasic (0.0.r19-8)

Links for gasic

Debian Resources:

Download Source Package gasic:

Maintainers:

External Resources:

Homepage [sourceforge.net]

Similar packages:

Lighedskorrektion for arvemasseoverflod

Et mål for sekvensbaseret metagenomisk analyse er den kvantitative taksonomiske vurdering af mikrobielle miljøsammensætninger. Imidlertid er flertallet af indgangsvinklerne enten kvantificer ved lav opløsning (f.eks. på rækkeniveau) eller de har alvorlige problemer angående meget lignende arter. Alligevel er nøjagtig kvantificering på artsniveau ønskelig i anvendelser såsom metagenomisk diagnostik eller fællesskabssammenligning. GASiC er en metode til at korrigere læste justeringsresultater for de uklarheder, der indførtes ved ligheder i arvemasser. Metoden har overlegen ydelse i forhold til eksisterende metoder.

Other Packages Related to gasic

depends

recommends

suggests

enhances

dep: bowtie

Ultrahurtig og hukommelseseffektiv short read-sammenligner
dep: bowtie2

Ultrahurtig og hukommelseseffektiv short read-sammenligner
dep: bwa

Burrows-Wheeler Aligner (sekvenssammenligner)
dep: python3

interactive high-level object-oriented language (default python3 version)
dep: python3-biopython

Python 3-bibliotek for bioinformatik
dep: python3-matplotlib

Pythonbaseret plotsystem i en stil svarende til Matlab - Python 3
dep: python3-numpy

Hurtig tabelfacilitet til Python 3-sproget
dep: python3-pysam

Grænseflade for SAM/BAM-sekvenssammenligning og oversættelsesformatet - Python 3
dep: python3-scipy

Videnskabelige værktøjer for Python 3
dep: seqan-apps

C++-bibliotek for analyse af biologiske sekvenser

sug: gasic-examples

Lighedskorrektion for arvemasseoverflod - dataeksempler

Download gasic

Download for all available architectures
Architecture	Package Size	Installed Size	Files
all	20.2 kB	80.0 kB	[list of files]