Пакет: libseqlib2 (1.2.0+dfsg-9)
Връзки за libseqlib2
Ресурси за Debian:
- Доклади за грешки
- Developer Information
- Журнал на промените в Debian
- Авторски права
- Управление на кръпките в Debian
Изтегляне на пакет-източник libseqlib.
- [libseqlib_1.2.0+dfsg-9.dsc]
- [libseqlib_1.2.0+dfsg.orig.tar.xz]
- [libseqlib_1.2.0+dfsg-9.debian.tar.xz]
Отговорници:
- Debian Med Packaging Team (Страница за QA, Пощенски архив)
- Andreas Tille (Страница за QA)
- Étienne Mollier (Страница за QA)
Външни препратки:
- Начална страница [github.com]
Подобни пакети:
C++ htslib/bwa-mem/fermi interface for interrogating sequence data
C++ API and command line tool that provides a rapid and user-friendly interface to BAM/SAM/CRAM files, global sequence alignment operations and sequence assembly. Four C libraries perform core operations in SeqLib: HTSlib for BAM access, BWA-MEM and BLAT for sequence alignment and Fermi for error correction and sequence assembly. Benchmarking indicates that SeqLib has lower CPU and memory requirements than leading C++ sequence analysis APIs. Minimal SeqLib code can extract, error-correct and assemble reads from a CRAM file and then align with BWA-MEM. SeqLib also provides additional capabilities, including chromosome-aware interval queries and read plotting. Command line tools are available for performing integrated error correction, micro-assemblies and alignment.
Други пакети, свързани с libseqlib2
|
|
|
|
-
- dep: libc6 (>= 2.33)
- GNU C Library: Shared libraries
също и виртуален пакет, предлаган от libc6-udeb
-
- dep: libfml0 (>= 0.1+git20190320.b499514)
- library for assembling Illumina short reads in small regions
-
- dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [не armel, armhf, mipsel]
- GCC support library
- dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]
- dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [mipsel]
-
- dep: libhts3 (>= 1.10)
- C library for high-throughput sequencing data formats
-
- dep: libjsoncpp25 (>= 1.9.5)
- library for reading and writing JSON for C++
-
- dep: libssw0 (>= 1.1)
- fast SIMD parallelized implementation of the Smith-Waterman algorithm
-
- dep: libstdc++6 (>= 11)
- GNU Standard C++ Library v3
-
- dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
- compression library - runtime
Изтегляне на libseqlib2
| Архитектура | Големина на пакета | Големина след инсталиране | Файлове |
|---|---|---|---|
| amd64 | 158,0 кБ | 553,0 кБ | [списък на файловете] |
| arm64 | 137,6 кБ | 468,0 кБ | [списък на файловете] |
| armel | 127,8 кБ | 467,0 кБ | [списък на файловете] |
| armhf | 132,5 кБ | 339,0 кБ | [списък на файловете] |
| i386 | 165,4 кБ | 499,0 кБ | [списък на файловете] |
| mips64el | 138,7 кБ | 557,0 кБ | [списък на файловете] |
| mipsel | 139,6 кБ | 551,0 кБ | [списък на файловете] |
| ppc64el | 162,4 кБ | 597,0 кБ | [списък на файловете] |
| s390x | 135,7 кБ | 496,0 кБ | [списък на файловете] |