Пакет: allelecount (4.3.0-2 и други)

Връзки за allelecount

Ресурси за Debian:

Изтегляне на пакет-източник allelecount.

Отговорници:

Външни препратки:

Начална страница [github.com]

Подобни пакети:

NGS copy number algorithms

Support code for NGS copy number algorithms. Takes a file of locations and a [cr|b]am file and generates a count of coverage of each allele [ACGT] at that location (given any filter settings).

The alleleCount package primarily exists to prevent code duplication between some other projects, specifically AscatNGS and Battenberg.

Други пакети, свързани с allelecount

зависимости

препоръчани

предложени

enhances

dep: libbz2-1.0 [sparc64]

high-quality block-sorting file compressor library - runtime
dep: libc6 (>= 2.34) [не alpha, ia64, sh4]

GNU C Library: Shared libraries
също и виртуален пакет, предлаган от libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]
dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

GNU C Library: Shared libraries
също и виртуален пакет, предлаган от libc6.1-udeb

dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]
dep: libhts3t64 (>= 1.17)

C library for high-throughput sequencing data formats
dep: liblzma5 (>= 5.1.1alpha+20110809) [sparc64]

XZ-format compression library
dep: zlib1g (>= 1:1.1.4) [sparc64]

compression library - runtime

Изтегляне на allelecount

Изтегляне за всички налични архитектури
Архитектура	Версия	Големина на пакета	Големина след инсталиране	Файлове
alpha (неофициална архитектура)	4.3.0-2+b1	28,2 кБ	119,0 кБ	[списък на файловете]
amd64	4.3.0-2+b1	28,7 кБ	91,0 кБ	[списък на файловете]
arm64	4.3.0-2+b1	27,8 кБ	119,0 кБ	[списък на файловете]
armel	4.3.0-2+b1	28,3 кБ	86,0 кБ	[списък на файловете]
armhf	4.3.0-2+b1	27,2 кБ	78,0 кБ	[списък на файловете]
hppa (неофициална архитектура)	4.3.0-2+b1	27,8 кБ	87,0 кБ	[списък на файловете]
i386	4.3.0-2+b1	29,1 кБ	90,0 кБ	[списък на файловете]
ia64 (неофициална архитектура)	4.3.0-2+b1	32,1 кБ	111,0 кБ	[списък на файловете]
m68k (неофициална архитектура)	4.3.0-2+b1	27,1 кБ	86,0 кБ	[списък на файловете]
mips64el	4.3.0-2+b1	27,3 кБ	121,0 кБ	[списък на файловете]
ppc64 (неофициална архитектура)	4.3.0-2+b1	29,4 кБ	119,0 кБ	[списък на файловете]
ppc64el	4.3.0-2+b1	30,0 кБ	119,0 кБ	[списък на файловете]
riscv64	4.3.0-2+b2	28,3 кБ	83,0 кБ	[списък на файловете]
s390x	4.3.0-2+b1	28,3 кБ	91,0 кБ	[списък на файловете]
sh4 (неофициална архитектура)	4.3.0-2+b1	29,2 кБ	118,0 кБ	[списък на файловете]
sparc64 (неофициална архитектура)	4.3.0-2+b1	27,2 кБ	1 081,0 кБ	[списък на файловете]
x32 (неофициална архитектура)	4.3.0-2+b1	28,7 кБ	90,0 кБ	[списък на файловете]