[ Källkod: allelecount ]
Paket: allelecount (4.3.0-2 och andra)
Länkar för allelecount
Debianresurser:
Hämta källkodspaketet allelecount:
Ansvariga:
Externa resurser:
- Hemsida [github.com]
Liknande paket:
NGS copy number algorithms
Support code for NGS copy number algorithms. Takes a file of locations and a [cr|b]am file and generates a count of coverage of each allele [ACGT] at that location (given any filter settings).
The alleleCount package primarily exists to prevent code duplication between some other projects, specifically AscatNGS and Battenberg.
Andra paket besläktade med allelecount
|
|
|
|
-
- dep: libbz2-1.0 [sparc64]
- high-quality block-sorting file compressor library - runtime
-
- dep: libc6 (>= 2.34) [ej alpha, ia64, sh4]
- GNU C-bibliotek: Delade bibliotek
också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6-udeb
- dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]
-
- dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]
- GNU C-bibliotek: Delade bibliotek
också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6.1-udeb
- dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]
-
- dep: libhts3t64 (>= 1.17)
- C library for high-throughput sequencing data formats
-
- dep: liblzma5 (>= 5.1.1alpha+20110809) [sparc64]
- XZ-format compression library
-
- dep: zlib1g (>= 1:1.1.4) [sparc64]
- Kompressionsbibliotek - körtidspaket
Hämta allelecount
| Arkitektur | Version | Paketstorlek | Installerad storlek | Filer |
|---|---|---|---|---|
| alpha (inofficiell anpassning) | 4.3.0-2+b1 | 28,2 kbyte | 119,0 kbyte | [filförteckning] |
| amd64 | 4.3.0-2+b1 | 28,7 kbyte | 91,0 kbyte | [filförteckning] |
| arm64 | 4.3.0-2+b2 | 27,8 kbyte | 119,0 kbyte | [filförteckning] |
| armel | 4.3.0-2+b1 | 28,3 kbyte | 86,0 kbyte | [filförteckning] |
| armhf | 4.3.0-2+b1 | 27,2 kbyte | 78,0 kbyte | [filförteckning] |
| hppa (inofficiell anpassning) | 4.3.0-2+b1 | 27,8 kbyte | 87,0 kbyte | [filförteckning] |
| i386 | 4.3.0-2+b1 | 29,1 kbyte | 90,0 kbyte | [filförteckning] |
| ia64 (inofficiell anpassning) | 4.3.0-2+b1 | 32,1 kbyte | 111,0 kbyte | [filförteckning] |
| m68k (inofficiell anpassning) | 4.3.0-2+b1 | 27,1 kbyte | 86,0 kbyte | [filförteckning] |
| mips64el | 4.3.0-2+b1 | 27,3 kbyte | 121,0 kbyte | [filförteckning] |
| ppc64 (inofficiell anpassning) | 4.3.0-2+b1 | 29,4 kbyte | 119,0 kbyte | [filförteckning] |
| ppc64el | 4.3.0-2+b1 | 30,0 kbyte | 119,0 kbyte | [filförteckning] |
| riscv64 | 4.3.0-2+b2 | 28,3 kbyte | 83,0 kbyte | [filförteckning] |
| s390x | 4.3.0-2+b1 | 28,3 kbyte | 91,0 kbyte | [filförteckning] |
| sh4 (inofficiell anpassning) | 4.3.0-2+b1 | 29,2 kbyte | 118,0 kbyte | [filförteckning] |
| sparc64 (inofficiell anpassning) | 4.3.0-2+b1 | 27,2 kbyte | 1.081,0 kbyte | [filförteckning] |
| x32 (inofficiell anpassning) | 4.3.0-2+b1 | 28,7 kbyte | 90,0 kbyte | [filförteckning] |