套件：allelecount（4.3.0-2 以及其他的）

allelecount 的相關連結

Debian 的資源：

下載原始碼套件 allelecount：

維護小組：

外部的資源：

主頁 [github.com]

相似套件：

NGS copy number algorithms

Support code for NGS copy number algorithms. Takes a file of locations and a [cr|b]am file and generates a count of coverage of each allele [ACGT] at that location (given any filter settings).

The alleleCount package primarily exists to prevent code duplication between some other projects, specifically AscatNGS and Battenberg.

其他與 allelecount 有關的套件

依賴

推薦

建議

增強

dep: libbz2-1.0 [sparc64]

high-quality block-sorting file compressor library - runtime
dep: libc6 (>= 2.34) [除 alpha, ia64, sh4]

GNU C 函式庫：共用函式庫
同時作為一個虛擬套件由這些套件填實： libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]
dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

GNU C 函式庫：共用函式庫
同時作為一個虛擬套件由這些套件填實： libc6.1-udeb

dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]
dep: libhts3t64 (>= 1.17)

C library for high-throughput sequencing data formats
dep: liblzma5 (>= 5.1.1alpha+20110809) [sparc64]

XZ-format compression library
dep: zlib1g (>= 1:1.1.4) [sparc64]

壓縮函式庫 - 跑程式時用(runtime)

下載 allelecount

下載可用於所有硬體架構的
硬體架構	版本	套件大小	安裝後大小	檔案
alpha （非官方移植版）	4.3.0-2+b1	28。2 kB	119。0 kB	[檔案列表]
amd64	4.3.0-2+b1	28。7 kB	91。0 kB	[檔案列表]
arm64	4.3.0-2+b1	27。8 kB	119。0 kB	[檔案列表]
armel	4.3.0-2+b1	28。3 kB	86。0 kB	[檔案列表]
armhf	4.3.0-2+b1	27。2 kB	78。0 kB	[檔案列表]
hppa （非官方移植版）	4.3.0-2+b1	27。8 kB	87。0 kB	[檔案列表]
i386	4.3.0-2+b1	29。1 kB	90。0 kB	[檔案列表]
ia64 （非官方移植版）	4.3.0-2+b1	32。1 kB	111。0 kB	[檔案列表]
m68k （非官方移植版）	4.3.0-2+b1	27。1 kB	86。0 kB	[檔案列表]
mips64el	4.3.0-2+b1	27。3 kB	121。0 kB	[檔案列表]
ppc64 （非官方移植版）	4.3.0-2+b1	29。4 kB	119。0 kB	[檔案列表]
ppc64el	4.3.0-2+b1	30。0 kB	119。0 kB	[檔案列表]
riscv64	4.3.0-2+b2	28。3 kB	83。0 kB	[檔案列表]
s390x	4.3.0-2+b1	28。3 kB	91。0 kB	[檔案列表]
sh4 （非官方移植版）	4.3.0-2+b1	29。2 kB	118。0 kB	[檔案列表]
sparc64 （非官方移植版）	4.3.0-2+b1	27。2 kB	1，081。0 kB	[檔案列表]
x32 （非官方移植版）	4.3.0-2+b1	28。7 kB	90。0 kB	[檔案列表]