[ 源代码: allelecount ]
软件包:allelecount(4.3.0-2 以及其他的)
NGS copy number algorithms
Support code for NGS copy number algorithms. Takes a file of locations and a [cr|b]am file and generates a count of coverage of each allele [ACGT] at that location (given any filter settings).
The alleleCount package primarily exists to prevent code duplication between some other projects, specifically AscatNGS and Battenberg.
其他与 allelecount 有关的软件包
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- dep: libbz2-1.0 [sparc64]
- 高品质块排序文件压缩程序库 - 运行时库
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- dep: libc6 (>= 2.34) [除 alpha, ia64, sh4]
- GNU C 语言运行库:共享库
同时作为一个虚包由这些包填实: libc6-udeb
- dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]
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- dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]
- GNU C 语言运行库:共享库
同时作为一个虚包由这些包填实: libc6.1-udeb
- dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]
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- dep: libhts3t64 (>= 1.17)
- C library for high-throughput sequencing data formats
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- dep: liblzma5 (>= 5.1.1alpha+20110809) [sparc64]
- XZ 格式压缩库
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- dep: zlib1g (>= 1:1.1.4) [sparc64]
- 压缩库 - 运行时
下载 allelecount
硬件架构 | 版本 | 软件包大小 | 安装后大小 | 文件 |
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alpha (非官方移植版) | 4.3.0-2+b1 | 28.2 kB | 119.0 kB | [文件列表] |
amd64 | 4.3.0-2+b1 | 28.7 kB | 91.0 kB | [文件列表] |
arm64 | 4.3.0-2+b1 | 27.8 kB | 119.0 kB | [文件列表] |
armel | 4.3.0-2+b1 | 28.3 kB | 86.0 kB | [文件列表] |
armhf | 4.3.0-2+b1 | 27.2 kB | 78.0 kB | [文件列表] |
hppa (非官方移植版) | 4.3.0-2+b1 | 27.8 kB | 87.0 kB | [文件列表] |
i386 | 4.3.0-2+b1 | 29.1 kB | 90.0 kB | [文件列表] |
ia64 (非官方移植版) | 4.3.0-2+b1 | 32.1 kB | 111.0 kB | [文件列表] |
m68k (非官方移植版) | 4.3.0-2+b1 | 27.1 kB | 86.0 kB | [文件列表] |
mips64el | 4.3.0-2+b1 | 27.3 kB | 121.0 kB | [文件列表] |
ppc64 (非官方移植版) | 4.3.0-2+b1 | 29.4 kB | 119.0 kB | [文件列表] |
ppc64el | 4.3.0-2+b1 | 30.0 kB | 119.0 kB | [文件列表] |
riscv64 | 4.3.0-2+b2 | 28.3 kB | 83.0 kB | [文件列表] |
s390x | 4.3.0-2+b1 | 28.3 kB | 91.0 kB | [文件列表] |
sh4 (非官方移植版) | 4.3.0-2+b1 | 29.2 kB | 118.0 kB | [文件列表] |
sparc64 (非官方移植版) | 4.3.0-2+b1 | 27.2 kB | 1,081.0 kB | [文件列表] |
x32 (非官方移植版) | 4.3.0-2+b1 | 28.7 kB | 90.0 kB | [文件列表] |