[ Източник: stacks ]
Пакет: stacks (2.55+dfsg-1)
Връзки за stacks
Ресурси за Debian:
- Доклади за грешки
- Developer Information
- Журнал на промените в Debian
- Авторски права
- Управление на кръпките в Debian
Изтегляне на пакет-източник stacks.
Отговорници:
- Debian Med Packaging Team (Страница за QA, Пощенски архив)
- Tim Booth (Страница за QA)
- Andreas Tille (Страница за QA)
Външни препратки:
- Начална страница [creskolab.uoregon.edu]
Подобни пакети:
pipeline for building loci from short-read DNA sequences
Stacks is a software pipeline for building loci from short-read sequences, such as those generated on the Illumina platform. Stacks was developed to work with restriction enzyme-based data, such as RAD-seq, for the purpose of building genetic maps and conducting population genomics and phylogeography.
Note that this package installs Stacks such that all commands must be run as: $ stacks <cmdname> <args>
Други пакети, свързани с stacks
|
|
|
|
-
- dep: libc6 (>= 2.29)
- GNU C Library: Shared libraries
също и виртуален пакет, предлаган от libc6-udeb
-
- dep: libdbi-perl
- Perl Database Interface (DBI)
-
- dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [не armel, armhf, ppc64el]
- GCC support library
- dep: libgcc-s1 (>= 3.4.4) [ppc64el]
- dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]
-
- dep: libgomp1 (>= 6)
- GCC OpenMP (GOMP) support library
-
- dep: libhts3 (>= 1.10)
- C library for high-throughput sequencing data formats
-
- dep: libstdc++6 (>= 9)
- GNU Standard C++ Library v3
-
- dep: samtools
- processing sequence alignments in SAM, BAM and CRAM formats
-
- dep: zlib1g (>= 1:1.2.6)
- compression library - runtime
-
- rec: libspreadsheet-writeexcel-perl
- module to create Excel spreadsheets
-
- rec: littler
- GNU R scripting and command-line front-end -- transition package
също и виртуален пакет, предлаган от r-cran-littler
-
- rec: python3
- interactive high-level object-oriented language (default python3 version)
Изтегляне на stacks
| Архитектура | Големина на пакета | Големина след инсталиране | Файлове |
|---|---|---|---|
| amd64 | 1 041,1 кБ | 5 465,0 кБ | [списък на файловете] |
| arm64 | 910,1 кБ | 4 849,0 кБ | [списък на файловете] |
| armel | 875,0 кБ | 4 664,0 кБ | [списък на файловете] |
| armhf | 900,6 кБ | 3 312,0 кБ | [списък на файловете] |
| i386 | 1 112,2 кБ | 5 680,0 кБ | [списък на файловете] |
| mips64el | 990,5 кБ | 6 867,0 кБ | [списък на файловете] |
| mipsel | 1 014,9 кБ | 6 522,0 кБ | [списък на файловете] |
| ppc64el | 1 033,4 кБ | 6 741,0 кБ | [списък на файловете] |
| s390x | 912,5 кБ | 5 601,0 кБ | [списък на файловете] |