[ 原始碼： maffilter ]
套件：maffilter（1.3.1+dfsg-6）
maffilter 的相關連結
Debian 的資源：
下載原始碼套件 maffilter：
- [maffilter_1.3.1+dfsg-6.dsc]
- [maffilter_1.3.1+dfsg.orig.tar.xz]
- [maffilter_1.3.1+dfsg-6.debian.tar.xz]
維護小組：
- Debian Med Packaging Team (QA 頁面, 郵件存檔)
- Andreas Tille (QA 頁面)
- Julien Dutheil (QA 頁面)
- Pranav Ballaney (QA 頁面)
外部的資源：
- 主頁 [jydu.github.io]
相似套件：
process genome alignment in the Multiple Alignment Format
MafFilter applies a series of "filters" to a MAF file, in order to clean it, extract data and computer statistics while keeping track of the associated meta-data such as genome coordinates and quality scores.
* It can process the alignment to remove low-quality / ambiguous / masked regions. * It can export data into a single or multiple alignment file in format such as Fasta or Clustal. * It can read annotation data in GFF or GTF format, and extract the corresponding alignment. * It can perform sliding windows calculations. * It can reconstruct phylogeny/genealogy along the genome alignment. * It can compute population genetics statistics, such as site frequency spectrum, number of fixed/polymorphic sites, etc.
其他與 maffilter 有關的套件
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- dep: libboost-iostreams1.74.0 (>= 1.74.0+ds1) [x32]
- Boost.Iostreams Library
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- dep: libboost-iostreams1.83.0 (>= 1.83.0) [除 x32]
- Boost.Iostreams Library
-
- dep: libbpp-core4t64 (>= 2.4.1)
- Bio++ Core library
-
- dep: libbpp-phyl-omics3t64 (>= 2.4.1)
- Bio++ Phylogenetics library: genomics components
-
- dep: libbpp-phyl12t64 (>= 2.4.1)
- Bio++ Phylogenetic library
-
- dep: libbpp-seq-omics3t64 (>= 2.4.1)
- Bio++ Sequence library: genomics components
-
- dep: libbpp-seq12t64 (>= 2.4.1)
- Bio++ Sequence library
-
- dep: libbz2-1.0 [sparc64]
- high-quality block-sorting file compressor library - runtime
-
- dep: libc6 (>= 2.34) [除 alpha, ia64, sh4]
- GNU C 函式庫：共用函式庫
同時作為一個虛擬套件由這些套件填實： libc6-udeb
- dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]
-
- dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]
- GNU C 函式庫：共用函式庫
同時作為一個虛擬套件由這些套件填實： libc6.1-udeb
- dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]
-
- dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, i386, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, x32]
- GCC 支援函式庫
- dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64, sh4, sparc64]
- dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]
- dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]
-
- dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]
- GCC 支援函式庫
-
- dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]
- GCC 支援函式庫
-
- dep: libstdc++6 (>= 13.1) [除 alpha]
- GNU Standard C++ Library v3
- dep: libstdc++6 (>= 14-20240221-2.1) [alpha]
-
- dep: libunwind8 [ia64]
- library to determine the call-chain of a program - runtime
-
- dep: zlib1g (>= 1:1.1.4) [sparc64]
- 壓縮函式庫 - 跑程式時用(runtime)
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- sug: maffilter-examples
- process genome alignment in the Multiple Alignment Format (example data)
下載 maffilter
| 硬體架構 | 套件大小 | 安裝後大小 | 檔案 |
|---|---|---|---|
| alpha （非官方移植版） | 240。8 kB | 1，373。0 kB | [檔案列表] |
| amd64 | 259。5 kB | 1，308。0 kB | [檔案列表] |
| arm64 | 237。9 kB | 1，368。0 kB | [檔案列表] |
| armel | 222。9 kB | 1，179。0 kB | [檔案列表] |
| armhf | 228。8 kB | 1，039。0 kB | [檔案列表] |
| hppa （非官方移植版） | 248。4 kB | 1，250。0 kB | [檔案列表] |
| i386 | 266。2 kB | 1，271。0 kB | [檔案列表] |
| ia64 （非官方移植版） | 273。0 kB | 1，911。0 kB | [檔案列表] |
| m68k （非官方移植版） | 248。5 kB | 1，255。0 kB | [檔案列表] |
| mips64el | 225。2 kB | 1，489。0 kB | [檔案列表] |
| ppc64 （非官方移植版） | 256。3 kB | 1，560。0 kB | [檔案列表] |
| ppc64el | 254。5 kB | 1，432。0 kB | [檔案列表] |
| riscv64 | 248。2 kB | 1，176。0 kB | [檔案列表] |
| s390x | 247。8 kB | 1，320。0 kB | [檔案列表] |
| sh4 （非官方移植版） | 284。3 kB | 1，304。0 kB | [檔案列表] |
| sparc64 （非官方移植版） | 220。7 kB | 1，503。0 kB | [檔案列表] |
| x32 （非官方移植版） | 258。5 kB | 1，251。0 kB | [檔案列表] |