[ 源代码： seqan-raptor ]
软件包：seqan-raptor（3.0.1+ds-5 以及其他的）
seqan-raptor 的相关链接
Debian 的资源：
下载源码包 seqan-raptor：
- [seqan-raptor_3.0.1+ds-5.dsc]
- [seqan-raptor_3.0.1+ds.orig.tar.xz]
- [seqan-raptor_3.0.1+ds-5.debian.tar.xz]
维护小组：
外部的资源：
- 主页 [github.com]
相似软件包：
pre-filter for querying very large collections of nucleotide sequences
Raptor is a system for approximately searching many queries such as next-generation sequencing reads or transcripts in large collections of nucleotide sequences. Raptor uses winnowing minimizers to define a set of representative k-mers, an extension of the interleaved Bloom filters (IBFs) as a set membership data structure and probabilistic thresholding for minimizers. This approach allows compression and partitioning of the IBF to enable the effective use of secondary memory.
其他与 seqan-raptor 有关的软件包
|
|
|
|
-
- dep: libbz2-1.0
- 高品质块排序文件压缩程序库 - 运行时库
-
- dep: libc6 (>= 2.34) [除 alpha, ia64]
- GNU C 语言运行库：共享库
同时作为一个虚包由这些包填实： libc6-udeb
-
- dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]
- GNU C 语言运行库：共享库
同时作为一个虚包由这些包填实： libc6.1-udeb
- dep: libc6.1 (>= 2.35) [ia64]
-
- dep: libgcc-s1 (>= 3.3.1) [arm64, ppc64el]
- GCC 支持库
- dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [除 arm64, ia64, ppc64el, sparc64]
- dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]
- dep: libgcc-s1 (>= 4.3) [sparc64]
-
- dep: libgomp1 (>= 6)
- GCC OpenMP（GOMP）支持库
-
- dep: libstdc++6 (>= 12) [ia64]
- GNU 标准 C++ 库，第3版
- dep: libstdc++6 (>= 13.1) [除 ia64]
-
- dep: libunwind8 [ia64]
- library to determine the call-chain of a program - runtime
-
- dep: libxxhash0 (>= 0.6.5) [sparc64]
- xxhash 共享库
-
- dep: libyaml-cpp0.7 (>= 0.7.0) [sparc64]
- YAML parser and emitter for C++
-
- dep: libyaml-cpp0.8 (>= 0.7.0) [除 ia64, ppc64, sparc64]
- YAML parser and emitter for C++
-
- dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
- 压缩库 - 运行时
-
- sug: cwl-runner
- 本虚包由这些包填实： cwltool, toil
下载 seqan-raptor
| 硬件架构 | 版本 | 软件包大小 | 安装后大小 | 文件 |
|---|---|---|---|---|
| alpha （非官方移植版） | 3.0.1+ds-5 | 579.4 kB | 2,362.0 kB | [文件列表] |
| amd64 | 3.0.1+ds-5 | 646.1 kB | 2,087.0 kB | [文件列表] |
| arm64 | 3.0.1+ds-5 | 551.8 kB | 1,911.0 kB | [文件列表] |
| ia64 （非官方移植版） | 2.0.0.0.git.fecfbca+ds-3 | 695.6 kB | 4,733.0 kB | [文件列表] |
| mips64el | 3.0.1+ds-5 | 529.1 kB | 2,319.0 kB | [文件列表] |
| ppc64 （非官方移植版） | 3.0.0+ds-2 | 458.7 kB | 1,831.0 kB | [文件列表] |
| ppc64el | 3.0.1+ds-5 | 633.6 kB | 2,359.0 kB | [文件列表] |
| riscv64 | 3.0.1+ds-5+b1 | 620.9 kB | 1,560.0 kB | [文件列表] |
| sparc64 （非官方移植版） | 3.0.1+ds-2 | 473.3 kB | 2,111.0 kB | [文件列表] |