[ Источник: seqan-raptor ]
Пакет: seqan-raptor (3.0.1+ds-5 и другие)
Ссылки для seqan-raptor
Ресурсы Debian:
- Сообщения об ошибках
- Developer Information
- Debian журнал изменений
- Файл авторских прав
- Отслеживание заплат Debian
Исходный код seqan-raptor:
- [seqan-raptor_3.0.1+ds-5.dsc]
- [seqan-raptor_3.0.1+ds.orig.tar.xz]
- [seqan-raptor_3.0.1+ds-5.debian.tar.xz]
Сопровождающие:
Внешние ресурсы:
- Сайт [github.com]
Подобные пакеты:
pre-filter for querying very large collections of nucleotide sequences
Raptor is a system for approximately searching many queries such as next-generation sequencing reads or transcripts in large collections of nucleotide sequences. Raptor uses winnowing minimizers to define a set of representative k-mers, an extension of the interleaved Bloom filters (IBFs) as a set membership data structure and probabilistic thresholding for minimizers. This approach allows compression and partitioning of the IBF to enable the effective use of secondary memory.
Другие пакеты, относящиеся к seqan-raptor
|
|
|
|
-
- dep: libbz2-1.0
- библиотека сжатия по алгоритму Барроуза—Уилера (динамическая версия)
-
- dep: libc6 (>= 2.34) [не alpha, ia64]
- библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb
-
- dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]
- библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
также виртуальный пакет, предоставляемый libc6.1-udeb
- dep: libc6.1 (>= 2.35) [ia64]
-
- dep: libgcc-s1 (>= 3.3.1) [arm64, ppc64el]
- вспомогательная библиотека GCC
- dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [не arm64, ia64, ppc64el, sparc64]
- dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]
- dep: libgcc-s1 (>= 4.3) [sparc64]
-
- dep: libgomp1 (>= 6)
- вспомогательная библиотека GCC OpenMP (GOMP)
-
- dep: libstdc++6 (>= 12) [ia64]
- стандартная библиотека GNU C++ версии 3
- dep: libstdc++6 (>= 13.1) [не arm64, ia64]
- dep: libstdc++6 (>= 14) [arm64]
-
- dep: libunwind8 [ia64]
- библиотека для выявления цепочки вызовов функций в программе
-
- dep: libxxhash0 (>= 0.6.5) [sparc64]
- библиотека для хеширования
-
- dep: libyaml-cpp0.7 (>= 0.7.0) [sparc64]
- YAML parser and emitter for C++
-
- dep: libyaml-cpp0.8 (>= 0.7.0) [не ia64, ppc64, sparc64]
- YAML parser and emitter for C++
-
- dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
- библиотека сжатия
-
- sug: cwl-runner
- виртуальный пакет, предоставляемый cwltool, toil
Загрузка seqan-raptor
| Архитектура | Версия | Размер пакета | В установленном виде | Файлы |
|---|---|---|---|---|
| alpha (неофициальный перенос) | 3.0.1+ds-5 | 579,4 Кб | 2 362,0 Кб | [список файлов] |
| amd64 | 3.0.1+ds-5 | 646,1 Кб | 2 087,0 Кб | [список файлов] |
| arm64 | 3.0.1+ds-5+b1 | 575,5 Кб | 1 976,0 Кб | [список файлов] |
| ia64 (неофициальный перенос) | 2.0.0.0.git.fecfbca+ds-3 | 695,6 Кб | 4 733,0 Кб | [список файлов] |
| mips64el | 3.0.1+ds-5 | 529,1 Кб | 2 319,0 Кб | [список файлов] |
| ppc64 (неофициальный перенос) | 3.0.0+ds-2 | 458,7 Кб | 1 831,0 Кб | [список файлов] |
| ppc64el | 3.0.1+ds-5 | 633,6 Кб | 2 359,0 Кб | [список файлов] |
| riscv64 | 3.0.1+ds-5+b1 | 620,9 Кб | 1 560,0 Кб | [список файлов] |
| sparc64 (неофициальный перенос) | 3.0.1+ds-2 | 473,3 Кб | 2 111,0 Кб | [список файлов] |