Пакунок: nanopolish (0.13.2-3)

Links for nanopolish

Debian Resources:

Download Source Package nanopolish:

Maintainers:

External Resources:

Homepage [github.com]

Similar packages:

consensus caller for nanopore sequencing data

Nanopolish uses a signal-level hidden Markov model for consensus calling of nanopore genome sequencing data. It can perform signal-level analysis of Oxford Nanopore sequencing data. Nanopolish can calculate an improved consensus sequence for a draft genome assembly, detect base modifications, call SNPs and indels with respect to a reference genome and more.

Інші пакунки пов'язані з nanopolish

depends

recommends

suggests

enhances

dep: libc6 (>= 2.29)

Бібліотека GNU C: спільні бібліотеки
also a virtual package provided by libc6-udeb
dep: libgcc-s1 (>= 3.3.1) [not armel, armhf, mipsel, ppc64el]

Допоміжна бібліотека GCC

dep: libgcc-s1 (>= 3.4.4) [ppc64el]

dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [mipsel]
dep: libgomp1 (>= 6)

Підтримувальна бібліотека GCC OpenMP (GOMP)
dep: libhdf5-103-1

HDF5 C runtime files - serial version
dep: libhts3 (>= 1.10)

C library for high-throughput sequencing data formats
dep: libstdc++6 (>= 9)

Стандартна бібліотека C++ GNU, версії 3
dep: perl

Мова Практичного Видобування та Побудування Звітів Лари Уолла (Larry Wall)
dep: python3

Інтерактивна обʼєктно-орієнтована мова високого рівня (типова версія „python3“)
dep: zlib1g (>= 1:1.1.4) [not arm64]

Бібліотека стискання даних (виконавчий модуль)

dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3) [arm64]

rec: python3-biopython

Python3 library for bioinformatics
rec: python3-pysam

interface for the SAM/BAM sequence alignment and mapping format (Python 3)

sug: make

Утиліта управління компіляцією
sug: perl

Мова Практичного Видобування та Побудування Звітів Лари Уолла (Larry Wall)

Завантажити nanopolish

Завантаження для всіх доступних архітектур
Архітектура	Розмір пакунка	Розмір після встановлення	Файли
amd64	2,199.8 kB	9,539.0 kB	[список файлів]
arm64	2,130.2 kB	9,334.0 kB	[список файлів]
armel	2,126.7 kB	9,405.0 kB	[список файлів]
armhf	2,141.1 kB	8,985.0 kB	[список файлів]
i386	2,247.0 kB	9,797.0 kB	[список файлів]
mips64el	2,140.4 kB	9,757.0 kB	[список файлів]
mipsel	2,163.9 kB	9,796.0 kB	[список файлів]
ppc64el	2,202.2 kB	9,795.0 kB	[список файлів]
s390x	2,134.3 kB	9,626.0 kB	[список файлів]