all options
buster  ] [  bullseye  ] [  bookworm  ] [  trixie  ] [  sid  ]
[ Source: parsnp  ]

Пакунок: parsnp (1.5.4+dfsg-1)

Links for parsnp

Screenshot

Debian Resources:

Download Source Package parsnp:

Maintainers:

External Resources:

Similar packages:

rapid core genome multi-alignment

Parsnp was designed to align the core genome of hundreds to thousands of bacterial genomes within a few minutes to few hours. Input can be both draft assemblies and finished genomes, and output includes variant (SNP) calls, core genome phylogeny and multi-alignments. Parsnp leverages contextual information provided by multi-alignments surrounding SNP sites for filtration/cleaning, in addition to existing tools for recombination detection/filtration and phylogenetic reconstruction.

Інші пакунки пов'язані з parsnp

  • depends
  • recommends
  • suggests
  • enhances

Завантажити parsnp

Завантаження для всіх доступних архітектур
Архітектура Розмір пакунка Розмір після встановлення Файли
amd64 185.2 kB1,881.0 kB [список файлів]
arm64 174.9 kB1,837.0 kB [список файлів]
armel 167.3 kB1,836.0 kB [список файлів]
armhf 164.4 kB1,760.0 kB [список файлів]
i386 188.3 kB1,900.0 kB [список файлів]
mips64el 185.0 kB1,927.0 kB [список файлів]
mipsel 187.4 kB1,925.0 kB [список файлів]
ppc64el 197.4 kB1,945.0 kB [список файлів]
s390x 169.9 kB1,885.0 kB [список файлів]